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棉花色素腺体发育相关基因GhERF105-like的克隆与表达分析
文献摘要：
为了探析GhERF105-like在棉花色素腺体发育或棉酚代谢中的功能,利用RT-PCR技术克隆了中棉所12 的GhERF105-like基因,并进行了生物信息学分析及表达模式分析.结果显示,GhERF105-like编码区为 711 bp,编码236 个氨基酸.GhERF105-like蛋白分子质量为 26.3 ku,理论等电点pI为 7.72;二级结构预测存在 22.88％的α-螺旋、13.14％的延伸链、3.81％的β-转角和60.17％的无规则卷曲.GhERF105-like在第 91-155 位氨基酸处存在 1 个AP2 结构域,预测有2 个苏氨酸、1 个酪氨酸和 1 个丝氨酸磷酸化位点位于 AP2 结构域内.系统进化分析表明,GhERF105-like及其同源蛋白基序组成在不同物种中保守程度较高,GhERF105-like与黄褐棉、达尔文氏棉、雷蒙德氏棉、海岛棉中同源蛋白的基序组成一致.GhERF105-like在有腺体棉中棉所 12 各个组织中的表达均显著或极显著高于无腺体棉中棉所12 显性无腺体;GhERF105-like在不同有腺体棉品种/系叶片中的表达量不同,且均显著高于显性或隐性无腺体棉品种/系.GhERF105-like受ABA、BR诱导显著上调表达,但在MeJA、Eth、NaCl和PEG处理下显著或极显著下调表达.综上所述,GhERF105-like与棉花色素腺体发育密切相关,可能通过ABA、BR、Eth和JA通路调控腺体发育或棉酚代谢.
文献关键词：
棉花;AP2/ERF转录因子;序列分析;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
张曦;钱玉源;王广恩;刘祎;权月伟;崔淑芳;米换房;李俊兰
作者机构：
河北省农林科学院 棉花研究所,农业部黄淮海半干旱区棉花生物学与遗传育种重点实验室,国家棉花改良中心河北分中心,河北 石家庄 050051;邯郸市农业科学院,河北 邯郸 056001
文献出处：
引用格式：
[1]张曦;钱玉源;王广恩;刘祎;权月伟;崔淑芳;米换房;李俊兰-.棉花色素腺体发育相关基因GhERF105-like的克隆与表达分析)[J].华北农学报,2022(06):34-41
A类：
GhERF105,黄褐棉
B类：
棉花,花色素,腺体,like,克隆与表达,表达分析,棉酚,生物信息学分析,表达模式分析,编码区,bp,分子质量,ku,等电点,pI,二级结构,结构预测,无规则,卷曲,AP2,结构域,苏氨酸,酪氨酸,丝氨酸,磷酸化,系统进化分析,同源蛋白,基序,达尔文,雷蒙德,海岛棉,同有,ABA,BR,MeJA,Eth,NaCl,PEG,综上所述,序列分析
AB值：
0.282016
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