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猪CAST基因多态性与生物信息学分析
文献摘要：
本研究旨在检测巴克夏猪、霍寿黑猪及其杂交F1代CAST基因多态性,并利用生物信息学分析碱基变异对mRNA二级结构以及CASTⅢ型蛋白的影响.结果表明,巴克夏猪、霍寿黑猪、巴克夏猪×霍寿黑猪都存在AA、AC和CC基因型,等位基因A的频率都高于等位基因C.该突变在3个猪群中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),呈中度多态(0.25C使猪CAST基因mRNA序列的二级结构发生一定变化,并且最小自由能增大.p.Arg660Ser导致猪CASTⅢ型蛋白的部分理化性质略有改变,包括分子式、分子量、等电点、不稳定系数、总平均亲水性、正电荷(Arg和Lys)数等.p.Arg660Ser突变未改变猪CASTⅢ型蛋白的二级结构,突变前后都是无规卷曲和α-螺旋占的比例较高.p.Arg660Ser突变不位于猪CASTⅢ型蛋白的保守结构域上,但可导致催化相邻位p.663Ser磷酸化的蛋白激酶数减少.综上,c.1980A>C突变可能对猪CAST基因的转录效率和功能产生一定影响.
文献关键词：
猪;CAST基因;多态性;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
许金根;靳二辉;王重龙;顾有方;李庆岗
作者机构：
安徽科技学院 动物科学学院,动物营养调控与健康安徽省重点实验室,安徽 凤阳233100;安徽省农业科学院 畜牧兽医研究所,安徽 合肥230031
文献出处：
引用格式：
[1]许金根;靳二辉;王重龙;顾有方;李庆岗-.猪CAST基因多态性与生物信息学分析)[J].浙江农业学报,2022(01):17-23
A类：
巴克夏猪,1980A,Arg660Ser,663Ser
B类：
CAST,基因多态性,生物信息学分析,黑猪,利用生物,碱基,二级结构,AA,AC,CC,基因型,等位基因,猪群,Hardy,Weinberg,平衡状态,PIC,自由能,分理,分子式,分子量,等电点,不稳定系数,亲水性,正电荷,Lys,未改,无规,卷曲,保守结构域,磷酸化,蛋白激酶
AB值：
0.26106
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