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谷子PAL基因家族全基因组的鉴定和表达分析
文献摘要：
苯丙氨酸解氢酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL)基因家族参与苯丙烷类代谢过程,通过调控植物抗病次生物质的合成在植物抗逆反应中发挥重要作用.为明确谷子PAL基因家族在逆境胁迫下的表达规律,该研究利用生物信息学方法对谷子PAL基因家族进行鉴定和表达分析.结果表明:谷子具有11个PAL基因,在进化树中可分为3个亚家族,SiPAL7独自进化为一支.通过构建蛋白结构域发现PAL基因家族成员均含有保守的PAL结构域.启动子分析显示,PAL基因含有应答激素、逆境胁迫等多种因子的顺式作用元件,说明PAL基因广泛参与不同生物学调控过程.RT-qPCR结果显示,谷子PAL基因家族多为诱导型表达,不同光照条件下PAL基因表达量变化明显,不同基因具有不同响应模式,说明谷子PAL基因家族在参与光调节反应中发挥重要作用.谷子PAL基因高度保守,广泛响应不同非生物胁迫,具有表达特异性.该研究结果为揭示PAL基因家族在调节谷子抗性及胁迫应答过程中的作用提供了参考.
文献关键词：
谷子;PAL基因家族;生物信息学分析;蛋白结构;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
孟亚轩;孙颖琦;赵心月;王凤霞;瓮巧云;刘颖慧
作者机构：
河北北方学院农林科技学院,河北张家口075000
文献出处：
引用格式：
[1]孟亚轩;孙颖琦;赵心月;王凤霞;瓮巧云;刘颖慧-.谷子PAL基因家族全基因组的鉴定和表达分析)[J].广西植物,2022(09):1572-1581
A类：
SiPAL7
B类：
谷子,基因家族,全基因组,表达分析,苯丙氨酸,酸解,phenylalanine,ammonia,lyase,家族参与,苯丙烷,代谢过程,植物抗病,生物质,抗逆,逆反应,逆境胁迫,表达规律,研究利用,利用生物,生物信息学方法,进化树,亚家族,独自,蛋白结构域,启动子分析,顺式作用元件,qPCR,诱导型,光照条件,基因表达量,响应模式,调节反应,非生物胁迫,达特,胁迫应答,生物信息学分析
AB值：
0.307929
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