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白菜CesA基因家族鉴定及表达模式分析
文献摘要：
为探究CesA基因家族在白菜生长发育及纤维素合成过程中的作用机制,该文通过生物信息学的方法,以白菜的全基因组序列为研究区域,进行理化特征、基因结构、进化特征、保守基序及结构域、顺式作用元件和组织表达等鉴定分析.结果表明:(1)共鉴定出16个编码纤维素合成酶亚基的CesA基因,该家族成员所编码蛋白的理论等电点为4.76～9.12,相对分子量为17.76～122.67 kD,长度为153～1089 aa.(2)15个基因不均匀地分布于白菜的7条染色体上,Bra036008定位于scaffold上.(3)大部分成员包含4～14个外显子,1～11个保守基序.(4)该家族具有保守的DDD-QXXRW保守功能域.(5)该家族编码蛋白主要分布在质膜上,二级结构以无规则卷曲与α-螺旋为主,多数成员都含有CesA蛋白典型的N端、C端和跨膜区.(6)CesA基因在茎中表达量相对较高,其中Bra011865、Bra023952和Bra029874在茎、叶、花中显著表达.该研究结果为后续深入研究CesA基因功能以及白菜生长发育研究奠定了基础.
文献关键词：
纤维素合成酶;白菜;CesA;基因家族;基因表达
中图分类号：
作者姓名：
马宇辰;赵玉梅;黄丹霖;张梦晴;吴晓宇;王洁;陈雨;黄家保;段巧红
作者机构：
山东农业大学 园艺科学与工程学院,山东 泰安271000;作物生物学国家重点实验室,山东 泰安271000
文献出处：
引用格式：
[1]马宇辰;赵玉梅;黄丹霖;张梦晴;吴晓宇;王洁;陈雨;黄家保;段巧红-.白菜CesA基因家族鉴定及表达模式分析)[J].广西植物,2022(12):2021-2031
A类：
Bra036008,QXXRW,Bra011865,Bra023952,Bra029874
B类：
白菜,CesA,基因家族鉴定,表达模式分析,合成过程,全基因组序列,理化特征,基因结构,进化特征,保守基序,结构域,顺式作用元件,组织表达,鉴定分析,纤维素合成酶,亚基,编码蛋白,等电点,相对分子量,kD,aa,scaffold,外显子,DDD,功能域,质膜,二级结构,无规则,卷曲,数成,基因功能
AB值：
0.315472
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