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典型文献
西藏大花红景天RcCATs与RcSODs基因克隆及功能分析
文献摘要:
为探究过氧化氢酶(CAT)和超氧化物歧化酶(SOD)基因家族成员在西藏大花红景天高原恶劣生境适应性中的作用,利用生物信息学和qRT-PCR技术对其RcCATs和RcSODs基因家族成员的序列和表达模式进行了分析,并构建RcCAT和RcSOD1的pYES2.0表达载体与pGBKT7诱饵载体,分别进行了酵母胁迫分析和拟南芥酵母文库中互作蛋白的筛选.结果显示:(1)大花红景天中共有2条RcCAT基因,3条RcSOD基因和1条Cu/Zn SOD铜伴侣基因RcCCS.生物信息学分析显示上述基因的氨基酸序列与其同源基因具有较高的相似性(66.37%~94.51%),且均没有跨膜结构域,亚细胞位置预测RcCATs位于过氧化物酶体,RcSODs和RcCCS位于细胞质或线粒体.(2)qRT-PCR结果显示6个基因在根、茎、叶三个器官中均有表达且主要在叶片中表达,低温胁迫和植物激素ABA对基因表达量的影响显著.(3)酵母胁迫结果显示异源表达RcCAT和RcSOD1基因的阳性酵母菌株在冷、热、盐、碱、重金属和H2 O2胁迫下的细胞活力均比pYES2.0空载菌株高.(4)通过酵母双杂交共筛选到4个与RcCAT互作明显的基因AtbHLH121(AT3G19860)、AtCPCK2(AT2G23070)、AtGRP4(AT5G50750)和AtRAPTOR1B(AT3G08850),3个与RcSOD1互作明显的基因AtEMB(AT5G11890)、AtMBP2(AT1G52030)和AtRH8(AT4G00660).综上结果表明,大花红景天能够通过RcCATs和RcSODs基因广泛参与调控其生长发育、胁迫响应等代谢途径来适应高原恶劣的环境.
文献关键词:
大花红景天;过氧化氢酶;超氧化物歧化酶;生物信息学;表达模式;互作蛋白
作者姓名:
王宏鹏;李一丹;滕彦娇;陈成彬;张力鹏
作者机构:
南开大学 生命科学学院,天津 300071
文献出处:
引用格式:
[1]王宏鹏;李一丹;滕彦娇;陈成彬;张力鹏-.西藏大花红景天RcCATs与RcSODs基因克隆及功能分析)[J].广西植物,2022(09):1590-1601
A类:
RcCATs,RcSODs,RcCAT,RcSOD1,胁迫分析,RcSOD,RcCCS,AtbHLH121,AT3G19860,AtCPCK2,AT2G23070,AtGRP4,AT5G50750,AtRAPTOR1B,AT3G08850,AtEMB,AT5G11890,AtMBP2,AT1G52030,AtRH8,AT4G00660
B类:
大花红景天,基因克隆,功能分析,过氧化氢酶,基因家族,生境适应性,利用生物,qRT,表达模式,pYES2,表达载体,pGBKT7,诱饵载体,拟南芥,母文,文库,互作蛋白,伴侣,生物信息学分析,氨基酸序列,同源基因,跨膜结构域,亚细胞,位置预测,过氧化物酶体,细胞质,低温胁迫,植物激素,ABA,基因表达量,异源表达,酵母菌株,H2,O2,细胞活力,空载,株高,酵母双杂交,胁迫响应,代谢途径
AB值:
0.197062
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