典型文献
茶树TIFY基因家族鉴定及非生物胁迫下表达分析
文献摘要:
TIFY基因家族在茶树激素信号转导及其逆境胁迫具有十分重要的作用.该文利用生物信息学方法对茶树基因组中的TIFY家族进行了鉴定,分析其理化性质、系统进化、基因结构、染色体定位、启动子区顺式作用元件、组织表达模式,并通过RT-qPCR对部分TIFY家族成员进行了非生物胁迫.结果表明:(1)茶树TIFY基因家族成员19个(CsTIFY1~CsTIFY19),分属于4个蛋白亚家族TIFY、JAZ、ZML和PPD,且不均匀地分布在8条染色体上,按照进化关系及结构特点可分为7组,每组内具有相似的基因结构与保守基序组成.(2)CsTIFYs基因的启动子区具有多种包含激素和非生物胁迫响应的顺式作用元件,通过实时荧光定量(RT-qPCR)分析其家族成员对在茉莉酸甲酯、盐(20%氯化钠)、冷(4℃)以及干旱(20%PEG-6000)处理下反应强烈,部分基因在根与顶芽中有较高的表达量.由此推测,TIFY基因家族可能在茶树激素信号调控、胁迫响应、生长和发育等多方面发挥功能作用.
文献关键词:
茶树;TIFY基因家族;成员鉴定;功能分析;基因表达
中图分类号:
作者姓名:
姚新转;张宝会;陈湖芳;吕立堂
作者机构:
贵州大学 茶学院,贵阳550025;贵州大学 生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室,贵阳550025
文献出处:
引用格式:
[1]姚新转;张宝会;陈湖芳;吕立堂-.茶树TIFY基因家族鉴定及非生物胁迫下表达分析)[J].广西植物,2022(12):2044-2055
A类:
CsTIFY1,CsTIFY19,CsTIFYs
B类:
茶树,基因家族鉴定,非生物胁迫,表达分析,激素信号,信号转导,逆境胁迫,利用生物,生物信息学方法,系统进化,基因结构,染色体定位,启动子区,顺式作用元件,组织表达模式,qPCR,分属,亚家族,JAZ,ZML,PPD,照进,进化关系,保守基序,胁迫响应,其家,茉莉酸甲酯,氯化钠,PEG,顶芽,信号调控,生长和发育,功能作用,成员鉴定,功能分析
AB值:
0.290448
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