典型文献
CBL-CIPK信号系统参与小桐子抗冷性形成的生物信息学分析
文献摘要：
类钙调磷酸酶B亚基蛋白(calcineurin B-like calcium sensor,CBL)属Ca2+结合蛋白,通过与类钙调磷酸酶B亚基互作蛋白激酶(calcineurin B-like calcium sensor interacting protein kinase,CIPK)互作介导Ca2+信号转导过程.CBL-CIPK信号系统参与了植物对多种逆境胁迫的响应过程.为深入探讨小桐子的抗冷性机制,该研究基于BLAST序列比对的方法,在全基因组水平对小桐子CBL与CIPK基因家族进行了鉴定,并对其系统进化、基因结构、表达特性及功能互作进行了解析.结果表明:(1)在小桐子基因组中共鉴定到8个CBL基因与18个CIPK基因,CBL与CIPK蛋白长度分别在211～257 aa与422～484 aa之间,等电点分别在4.65～5.08与6.20～9.26之间.(2)另外,CBL基因家族都包含8～10个外显子,而CIPK基因家族分为显著的1～2个外显子(11个基因)和12～15个外显子(7个基因)两类.(3)多序列比对显示,小桐子CBL蛋白都鉴定到1个由14个氨基酸残基组成的非典型EF-hand基序与3个取代程度不同的典型EF-hand基序,而CIPK蛋白都包含N端激酶结构域与C端自抑制FISL/NAF结构域.(4)染色体定位显示,26个小桐子CBL与CIPK基因不均匀地分布于9条染色体上.(5)转录组数据分析表明,大部分CBL与CIPK基因在小桐子叶片、根及种子中都有高水平表达,其中JcCIPK14与JcCIPK18在低温处理时上调表达量达到了极显著水平(P<0.01),参与小桐子的抗冷性过程.综上结果为开展小桐子CBL和CIPK基因的功能鉴定与低温信号转导机制研究提供了借鉴.
文献关键词：
小桐子;蛋白激酶;CBL-CIPK;基因家族;表达分析;抗冷性
中图分类号：
作者姓名：
王海波;李芙蓉;杨金翠;郭俊云
作者机构：
曲靖师范学院 生物资源与食品工程学院, 云南 曲靖 655011;曲靖师范学院 云南省高校云贵高原动植物遗传多样性及生态适应性进化重点实验室, 云南 曲靖 655011
文献出处：
引用格式：
[1]王海波;李芙蓉;杨金翠;郭俊云-.CBL-CIPK信号系统参与小桐子抗冷性形成的生物信息学分析)[J].广西植物,2022(06):996-1007
A类：
FISL,JcCIPK14,JcCIPK18
B类：
CBL,信号系统,小桐子,抗冷性,生物信息学分析,亚基,calcineurin,like,calcium,sensor,Ca2+,结合蛋白,互作蛋白,蛋白激酶,interacting,protein,kinase,信号转导,逆境胁迫,响应过程,BLAST,全基因组,基因家族,系统进化,基因结构,表达特性,aa,等电点,外显子,多序列比对,氨基酸残基,基组,非典型,EF,hand,基序,酶结构,结构域,自抑,NAF,染色体定位,转录组数据,子叶,低温处理,显著水平,功能鉴定,表达分析
AB值：
0.25803
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