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2020年文山州手足口病病原监测及柯萨奇病毒A6型、A16型的基因特征分析
文献摘要：
目的:了解2020年文山州手足口病患儿病原学特征并对柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6，CVA6)和CVA16 VP1区基因特征进行分析。方法:直接从2020年云南省手足口病实验室监测系统收集的文山州手足口病患儿粪便标本中提取病毒核酸，先用MD91/OL68-1引物扩增肠道病毒(enterovirus, EV)VP4/VP2结合区基因并进行测序，确定病毒型别，再用各型病毒的相关引物扩增VP1区全序并测序，进行基因特征分析。按参考文献下载基因库中CVA6和CVA16 VP1区参考序列，用MEGA5.2软件构建系统进化树，进行基因特征和分子流行病学分析。结果:共从317份标本中检测到32株EV，1株星状病毒MLB1型(astrovirus MLB1)。病毒总体检出率为10.41%(33/317)，EV检出率为10.09%(32/317)，其中肠道病毒A组(enterovirus species A, EVA)31株，占EV阳性数的96.88%(31/32)，EVB组病毒1株，占3.12%(1/32)，未检测到EVC和EVD组病毒。EV中，检出率最高的病毒是CVA6，占62.50%(20/32)，其次是CVA16(18.75%，6/32)、CVA4(9.37%，3/32)、CVA10(3.12%，1/32)，未检测到EVA71病毒。基因进化分析表明20株CVA6为D3a亚型，并可分为3个进化分支。6株CVA16为B1a亚型，是中国一直流行的基因型，文山州6株B1a亚型可分为两个进化分支。结论:2020年云南省文山州手足口病的病原检测率为10.41%，EV中CVA6是主要的流行毒株，其次是CVA16。基于VP1区基因特征分析表明，2020年文山州手足口病的主要病原是CVA6 D3a亚型，其次是CVA16 B1a亚型，未检测到EVA71。
文献关键词：
手足口病;柯萨奇病毒A组6型;柯萨奇病毒A组16型;基因特征分析
中图分类号：
作者姓名：
周雪花;杨溪;姜黎黎;寸建萍;周晓芳;田炳均
作者机构：
文山州疾病预防控制中心检验科，文山 663099;云南省疾病预防控制中心急性传染病防制所，昆明 650022
文献出处：
引用格式：
[1]周雪花;杨溪;姜黎黎;寸建萍;周晓芳;田炳均-.2020年文山州手足口病病原监测及柯萨奇病毒A6型、A16型的基因特征分析)[J].中华微生物学和免疫学杂志,2022(06):478-483
A类：
MD91,OL68,MLB1,EVA71
B类：
手足口病,病原监测,柯萨奇病毒,基因特征分析,病原学特征,coxsackievirus,CVA6,CVA16,VP1,实验室监测,统收,粪便标本,病毒核酸,先用,引物,肠道病毒,enterovirus,VP4,VP2,型别,各型,全序,参考文献,下载,基因库,参考序列,MEGA5,软件构建,建系,系统进化树,分子流行病学,流行病学分析,星状病毒,astrovirus,中肠,species,EVB,未检,EVC,EVD,CVA4,CVA10,基因进化,进化分析,D3a,进化分支,B1a,基因型,云南省文山州,病原检测,检测率,流行毒株,主要病原,原是
AB值：
0.30544
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