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白鲜种子休眠解除过程中的转录组分析
文献摘要：
以解除休眠过程不同阶段的种子为材料,通过高通量测序技术对样品转录组进行测序分析.共获得135.98 Gb的原始数据,302453条Unigenes,注释到七大功能数据库(GO、KEGG、KOG、NR、TrEMBL、Pfam、Swiss-Prot),分别有139276(NR:46.05％)、128449(TrEMBL:42.47％)、86498(Swiss-Prot:28.60％)、90564(KOG:29.94％)、103481(KEGG:34.21％)、108540(GO:35.89％)以及90410(Pfam:29.89％)条Unigenes得到功能注释.通过GO分类和KEGG Pathway富集性分析,分别归于59个GO类别和145条代谢途径.同时,有6081个Unigenes被注释为转录因子.利用高通量测序技术获得白鲜转录组信息,有助于从分子水平对白鲜进行深入研究.
文献关键词：
白鲜;休眠解除;转录组;功能注释
中图分类号：
作者姓名：
闫宗圣;王乾;王蕾;张兰兰;郑开颜;郑玉光;尚晓瑛;房慧勇
作者机构：
河北中医学院药学院,石家庄 050200;河北省中药炮制技术创新中心,石家庄 050200;北京盈科瑞创新医药股份有限公司,北京 102200
文献出处：
引用格式：
[1]闫宗圣;王乾;王蕾;张兰兰;郑开颜;郑玉光;尚晓瑛;房慧勇-.白鲜种子休眠解除过程中的转录组分析)[J].种子,2022(12):35-40
A类：
TrEMBL
B类：
白鲜,种子休眠解除,除过,转录组分析,高通量测序技术,测序分析,共获,Gb,原始数据,Unigenes,KOG,NR,Pfam,Swiss,Prot,功能注释,Pathway,归于,代谢途径,技术获得,分子水平
AB值：
0.296212
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