典型文献
脊尾白虾响应环境胁迫的转录组学分析
文献摘要：
脊尾白虾(Palaemon carinicauda)是我国沿海滩涂混养的重要经济虾类,具有广盐、广温、抗病力和繁殖力强等优点.采用高通量测序技术对脊尾白虾转录组进行测序,对得到的转录本进行COG(clusters of orthologous groups)、GO(gene ontology)和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)分类和注释,旨在深入探讨环境胁迫(低盐、低温和溶解氧)对脊尾白虾重要相关调控基因的影响.本次测序低盐、低温和溶解氧处理组和对照组均产出＞35×106条高质量序列,碱基数均＞4 Gb,GC含量均＞43％,Q30碱基百分比均＞92％.组装得到转录本436 023条和unigene 305 682条,转录本和unigene的N50分别是814 bp和552 bp.unigene大部分(56 898条)注释到NR数据库,31 695条注释到KEGG数据库,28 919条注释到GO数据库.低温胁迫产生的差异表达基因中,具有显著性表达差异的有264条,包括上调基因215条和下调基因49条;低氧胁迫没有产生显著差异表达的基因,反观低盐胁迫有且仅有1条显著下调的基因,为α-葡糖苷酶(α-glucosidase).低盐胁迫下α-葡萄糖苷酶表达量显著降低,可能导致脊尾白虾虾体难以维持正常的能量需求.GO富集分析发现,低温胁迫下最显著的功能节点是脂质转运活性(lipid transporter activity)和肽基二肽酶活性(peptidyl-dipeptidase activity);而KEGG通路富集分析显示,差异表达基因显著富集到肾素-血管紧张素系统(renin-angiotensin system)中,推测低温通过抑制血管紧张素转换酶(angiotensin converting enzyme)的表达,降低了血管紧张素Ⅱ(angiotensin Ⅱ)的生成,从而降低血管平滑肌张力,抑制血压的升高和组织损伤;同时动员脂肪和蛋白质等能源物质,以响应低温胁迫.
文献关键词：
脊尾白虾;环境胁迫;转录组分析;差异表达基因;高通量测序
中图分类号：
作者姓名：
王兴强;卢雪旎;沈晔;曹梅;韦寿永;李庆国;茆丹婷;秦传新
作者机构：
江苏海洋大学海洋科学与水产学院,江苏连云港222005;连云港旺岛旅游开发有限公司,江苏连云港222000;中国水产科学研究院南海水产研究所,广东广州510300
文献出处：
引用格式：
[1]王兴强;卢雪旎;沈晔;曹梅;韦寿永;李庆国;茆丹婷;秦传新-.脊尾白虾响应环境胁迫的转录组学分析)[J].江苏农业科学,2022(03):22-27
A类：
Palaemon,dipeptidase
B类：
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AB值：
0.401901
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