典型文献
小RNA测序揭示miRNAs在油棕合子胚发育中的作用
文献摘要：
油棕是世界上产油效率最高的热带木本油料作物,其棕榈油产量与合子胚发育密切相关.油棕的合子胚发育是一个系统且复杂的生物过程,其中涉及许多基因的精确调控.MicroRNAs(miRNAs)是重要的信号分子,调节植物的各种发育过程.一些miRNAs已经被整合到基因调控网络中协调植物胚发育的可塑性,但对于其在油棕合子胚发育过程中的作用知之甚少.本研究采用小RNA测序对油棕S1(早期)、S2(中期)和S3(晚期)的合子胚进行高通量测序分析,鉴定了6个已存在的和334个已知的miRNAs,并预测到376个新的miRNAs.其中97、102和19个miRNAs在S1与S2、S1与S3、S2与S3之间差异表达;从S1到S3共有7个miRNAs持续差异表达.另外,miRNAs在调控胚胎早期和晚期的发育差异明显,即与S1相比,S2有36个miRNAs上调和61个miRNAs下调,但与S2相比,S3只有12个miRNAs上调和7个miRNAs下调.依据表达量的变化将135个miRNAs划分为4种趋势,并将对应的938个靶基因与转录组数据进行关联分析,检测到71个miRNA靶基因对.GO富集分析显示7个miRNAs的9个靶基因富集到152个生物过程,且与生长发育相关的基因被鉴定为miRNAs的靶标,表明miRNAs可能在调控油棕胚发育的激素信号、生殖生长等生物学过程中发挥作用.另外,KEGG分析表明miRNAs通过调控次生代谢途径相关基因影响合子胚的成熟.进一步筛选出4个miRNAs家族参与植物激素的合成和信号传导调控:miR159-MYB调控赤霉素和脱落酸来维持胚的发生潜力以及诱导胚成熟,miR 164-NAC调控乙烯和生长素参与胚细胞扩增,miR 172-AP2调控乙烯和脱落酸诱导胚成熟,novel-m004-SPL调控赤霉素来诱导胚的形态建成.本研究初步鉴定了参与油棕合子胚发育相关的miRNAs,为后续研究miRNAs调控合子胚发育的分子机制奠定基础.
文献关键词：
油棕;胚发育;miRNAs;激素
中图分类号：
作者姓名：
张安妮;曹红星;陈萍;金龙飞
作者机构：
海南大学园艺学院/海南省热带园艺作物品质调控重点实验室,海南海口 570228;中国热带农业科学院椰子研究所/海南省热带油料作物生物学重点实验室,海南文昌571339
文献出处：
引用格式：
[1]张安妮;曹红星;陈萍;金龙飞-.小RNA测序揭示miRNAs在油棕合子胚发育中的作用)[J].热带作物学报,2022(01):19-26
A类：
m004
B类：
miRNAs,油棕,合子,胚发育,产油,木本油料,油料作物,棕榈油,生物过程,多基因,MicroRNAs,信号分子,合到,基因调控网络,可塑性,知之甚少,S1,S2,S3,高通量测序分析,差异表达,发育差异,靶基因,转录组数据,富集分析,基因富集,靶标,控油,激素信号,生殖生长,生物学过程,次生代谢,代谢途径,家族参与,植物激素,信号传导,导调,miR159,MYB,赤霉素,脱落酸,NAC,生长素,细胞扩增,AP2,novel,SPL,素来,形态建成
AB值：
0.299772
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