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典型文献
大麦气孔发育相关基因HvSPCH的克隆及初步功能分析
文献摘要:
气孔是植物与外界进行气体交换的通道,对植物的生长发育至关重要.SPCH转录因子与气孔的发育关系密切,为揭示其在大麦中的功能,以大麦G1614为材料,利用PCR方法克隆大麦SPCH(HvSPCH)基因后,进行生物信息学分析,并对该基因在干旱胁迫条件下的表达模式进行分析.结果表明,HvSPCH基因编码区长为1 098 bp,可编码365个氨基酸,相对分子量为90 504.73 Da,理论等电点为4.96,为疏水的、不稳定的碱性蛋白质.氨基酸序列分析表明,HvSPCH蛋白的氨基酸序列不含有跨膜结构域和信号肽,含有40个磷酸化位点和27个糖基化位点.二级结构分析表明,HvSPCH蛋白包含35.62%的α-螺旋、8.77%的延长链、2.47%的β-转角和53.13%的无规则卷曲.系统进化分析表明,大麦HvSPCH蛋白与水稻、野生二粒小麦、二穗短柄草的SPCH蛋白亲缘关系较近.qRT-PCR分析结果表明,干旱处理4 h和12 h时,HvSPCH基因的相对表达量显著升高,说明其有可能参与大麦的干旱逆境响应过程.
文献关键词:
大麦;气孔发育;SPCH转录因子;基因克隆
作者姓名:
次尔甲玛;王宏鹏;苟筱颖;佟可心;郭瑞超;王俊斌;曹高燚;包曙光;谢晓东;陈小强
作者机构:
天津农学院农学与资源环境学院,天津300384
文献出处:
引用格式:
[1]次尔甲玛;王宏鹏;苟筱颖;佟可心;郭瑞超;王俊斌;曹高燚;包曙光;谢晓东;陈小强-.大麦气孔发育相关基因HvSPCH的克隆及初步功能分析)[J].麦类作物学报,2022(10):1175-1181
A类:
HvSPCH,SPCH,G1614
B类:
大麦,气孔发育,功能分析,行气,气体交换,对植,生物信息学分析,干旱胁迫,胁迫条件,表达模式,基因编码,编码区,区长,bp,可编,相对分子量,Da,等电点,疏水,氨基酸序列,序列分析,跨膜结构域,信号肽,磷酸化,糖基化位点,二级结构,白包,长链,无规则,卷曲,系统进化分析,水稻,野生二粒小麦,二穗短柄草,亲缘关系,qRT,旱处理,相对表达量,干旱逆境,逆境响应,响应过程,基因克隆
AB值:
0.329279
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