典型文献
大蒜AsPEX7基因的克隆与非生物胁迫响应分析
文献摘要:
为了解大蒜PEX7基因及其编码的蛋白质结构特性,分析该基因对不同非生物胁迫的响应情况,从大蒜品种徐紫1号的叶片RNA中克隆获得AsPEX7基因.序列分析结果表明,AsPEX7基因含有1个长度为951 bp的开放阅读框(ORF),编码316个氨基酸,其相对分子质量为35.57 ku,理论等电点为5.55,为亲水性蛋白.氨基酸组成中脂肪族氨基酸的比例最高,其次为碱性氨基酸,酸性氨基酸和芳香族氨基酸最低.AsPEX7蛋白含有25个磷酸化位点,无信号肽和跨膜结构,二级结构由α-螺旋、延伸主链和随机卷曲组成,比例分别为5.06%、40.19%和47.15%.实时荧光定量PCR(RT-qPCR)结果显示,在高温(38℃)、低温(4℃)、干旱(质量体积分数为20%的PEG 6000)和高盐(200 mmol/L NaCl)4种非生物胁迫处理条件下,AsPEX7基因的相对表达水平总体升高,表明该基因可能在抵抗非生物胁迫中发挥重要作用.本研究结果为深入解析PEX7基因调控大蒜生长发育及非生物胁迫的分子机制提供了理论参考基础.
文献关键词:
大蒜;AsPEX7基因;基因克隆;非生物胁迫;表达分析
中图分类号:
作者姓名:
杨青青;赵永强;刘灿玉;葛洁;陆信娟;张碧薇;杨峰;樊继德
作者机构:
江苏徐淮地区徐州农业科学研究所,江苏徐州221121
文献出处:
引用格式:
[1]杨青青;赵永强;刘灿玉;葛洁;陆信娟;张碧薇;杨峰;樊继德-.大蒜AsPEX7基因的克隆与非生物胁迫响应分析)[J].江苏农业科学,2022(06):24-31
A类:
AsPEX7,PEX7
B类:
胁迫响应,响应分析,蛋白质结构,结构特性,大蒜品种,序列分析,bp,开放阅读框,ORF,相对分子质量,ku,等电点,亲水性,氨基酸组成,脂肪族,碱性氨基酸,酸性氨基酸,芳香族氨基酸,磷酸化,信号肽,膜结构,二级结构,主链,卷曲,qPCR,PEG,高盐,NaCl,非生物胁迫处理,处理条件,相对表达,抗非,基因调控,基因克隆,表达分析
AB值:
0.299996
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