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萝卜赤霉素生物合成和信号转导相关基因的全基因组鉴定及表达分析
文献摘要：
赤霉素途径是植物开花调控中的一条重要途径.为了解赤霉素途径相关基因在萝卜开花调控中的作用,利用生物信息学方法对萝卜赤霉素生物合成和信号转导相关基因的结构、理化性质、染色体分布、启动子顺式作用元件和组织特异性表达进行了分析,并对不同开花期萝卜材料中这些基因的表达水平进行了实时荧光定量 PCR检测.结果表明,萝卜基因组含有46 个赤霉素生物合成和信号转导相关基因,CPS、KS、KO、KAO、GA20OX、GA3OX、GA2OX、GAI、RGA、RGL、GID1、SKP2 分别有2,1,2,2,9,5,12,1,1,4,3,4 个,它们不均匀分布于 9 条染色体上,其编码蛋白质分子质量为21.32～127.80 ku,等电点为4.72～9.04;基因结构和保守结构域分析发现,这 46 个基因的外显子数为1～21个不等,且一些保守基序为大部分基因所共有.启动子顺式作用元件分析表明,这 46 个基因的启动子含有与光、赤霉素、生长素、ABA、SA、低温、干旱等响应的顺式作用元件.利用萝卜基因表达数据库分析发现,这 46 个基因在不同组织和不同发育时期的表达量不同;实时荧光定量PCR检测表明,这些基因在早开花材料心里美萝卜和晚开花材料野萝卜中的表达量有明显差异,暗示其可能与萝卜的生殖生长有较密切的关系.
文献关键词：
萝卜;赤霉素生物合成;信号转导;基因;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
阳文龙;李锡香;张晓辉;宋江萍;贾会霞;王海平
作者机构：
中国农业科学院 蔬菜花卉研究所,北京 100081
文献出处：
引用格式：
[1]阳文龙;李锡香;张晓辉;宋江萍;贾会霞;王海平-.萝卜赤霉素生物合成和信号转导相关基因的全基因组鉴定及表达分析)[J].华北农学报,2022(06):1-14
A类：
KAO,GA20OX,GA3OX,GA2OX
B类：
萝卜,赤霉素生物合成,信号转导,全基因组鉴定,表达分析,开花调控,利用生物,生物信息学方法,启动子,顺式作用元件,组织特异性,特异性表达,开花期,CPS,KS,KO,GAI,RGA,RGL,GID1,SKP2,不均匀分布,编码蛋白,分子质量,ku,等电点,基因结构,保守结构域,外显子,保守基序,生长素,ABA,SA,基因表达数据库,数据库分析,不同组织,不同发育时期,心里美,暗示,生殖生长
AB值：
0.310812
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