典型文献
刺梨CaM基因的鉴定及其在果实中的表达特点
文献摘要:
钙调蛋白(calmodulin,CaMs)是植物主要的钙结合蛋白,在植物体内参与广泛的生理过程.本研究从刺梨(Rosa roxburghii)全基因组水平鉴定出2个编码CaM蛋白的基因,分别命名为RrCaM1(GenBank No.ON886228)和RrCaM2(GenBank No.ON886229),均含有4个典型的EF-hand功能域.其中RrCaM1基因含有3个内含子,而RrCaM2基因无内含子,分别定位于3号和4号染色体上.系统发育及共线性分析表明,刺梨CaM与白梨(Pyrus bretschneideri)、草莓(Fragaria vesca)之间的亲缘关系较近,RrCaM1和RrCaM2可分别聚于2个不同的亚类,且RrCaM1和RrCaM2分别与草莓有1个直系同源基因,而RrCaM1与白梨有2个直系同源基因.RNA-Seq与qPCR结果均表明,RrCaM2基因表达量随刺梨果实发育显著下降(P<0.05),RrCaM1则相反.顺式作用元件预测RrCaM1的启动子区包含激素、光等8类响应元件,而RrCaM2缺少响应赤霉素、低温、干旱等的顺式作用元件;外源激素处理的结果证实,2个成员对水杨酸(salicylic acid,SA)、脱落酸(abscisic acid,ABA)和赤霉素(gibberellin,GA3)等外源激素处理呈现不同的表达模式.钙调蛋白抑制剂(chlorpromazine,CPZ)处理显著抑制RrCaM表达并降低了刺梨果实维生素C(ascorbate,AsA)的合成,且与AsA合成相关基因(L-galactose phosphatase,RrGPP)和AsA循环基因(dehydroascorbate reductase,RrDHAR)的表达量呈显著正相关(P<0.05),提示其可能参与了刺梨果实AsA积累的调控.本研究发现,RrCaMs基因家族在刺梨果实发育、AsA积累与激素响应中具有潜在的重要作用,为该基因家族的功能研究提供了参考.
文献关键词:
刺梨;钙调蛋白(CaMs);基因表达;维生素C (AsA)
中图分类号:
作者姓名:
赵熳秋;南红;鲁敏;安华明
作者机构:
贵州大学国家林业和草原局刺梨工程技术研究中心,贵阳550025
文献出处:
引用格式:
[1]赵熳秋;南红;鲁敏;安华明-.刺梨CaM基因的鉴定及其在果实中的表达特点)[J].农业生物技术学报,2022(09):1724-1736
A类:
CaMs,RrCaM1,ON886228,RrCaM2,ON886229,chlorpromazine,RrCaM,RrGPP,dehydroascorbate,RrDHAR,RrCaMs
B类:
表达特点,钙调蛋白,calmodulin,钙结合蛋白,植物体,内参,生理过程,Rosa,roxburghii,全基因组,GenBank,No,EF,hand,功能域,内含子,系统发育,共线性分析,白梨,Pyrus,bretschneideri,草莓,Fragaria,vesca,亲缘关系,亚类,直系同源基因,Seq,qPCR,基因表达量,刺梨果,梨果实,果实发育,顺式作用元件,启动子区,响应元,赤霉素,外源激素,激素处理,水杨酸,salicylic,acid,SA,脱落酸,abscisic,ABA,gibberellin,GA3,表达模式,蛋白抑制剂,CPZ,AsA,galactose,phosphatase,循环基,reductase,基因家族,激素响应,功能研究
AB值:
0.30488
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