典型文献
玉米DREB转录因子家族的全基因组鉴定与分析
文献摘要:
借助生物信息学手段,从玉米DREB家族基因的鉴定、基因结构、顺式作用元件等多角度进行解析,以期了解其在抗逆途径中的潜在功能.结果表明:玉米中共有87个DREB家族成员,分为6个亚组,理化性质分析结果表明其编码的氨基酸序列长度为125~452个氨基酸,均编码亲水性蛋白;在玉米10条染色体上均有分布,在4号、5号染色体长臂处较为集中;仅有少数基因含有内含子,大多数成员只以CDS的形式存在且在各亚组之间保守;启动子区域除含有MBS等响应干旱胁迫的元件外,还含有响应赤霉素、ABA、MeJA等相关调控途径的元件;物种共线性分析结果表明,高粱与玉米DREB家族成员之间存在共线性特征,且部分基因呈现倍性关系;基于转录组数据的表达模式分析显示,在干旱、盐、干旱和盐双重胁迫处理下,仅有几个基因的表达水平显著升高,多数DREB家族基因以下调的表达方式参与胁迫响应.
文献关键词:
玉米;DREB家族基因;生物信息学;全基因组鉴定
中图分类号:
作者姓名:
王雷立;董柯清;张严玲;刘青青;王翠玲
作者机构:
河南科技大学农学院,河南 洛阳 471023
文献出处:
引用格式:
[1]王雷立;董柯清;张严玲;刘青青;王翠玲-.玉米DREB转录因子家族的全基因组鉴定与分析)[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2022(03):270-281
A类:
B类:
DREB,全基因组鉴定,家族基因,基因结构,顺式作用元件,抗逆,性质分析,氨基酸序列,亲水性,体长,长臂,内含子,数成,CDS,启动子区域,MBS,干旱胁迫,赤霉素,ABA,MeJA,调控途径,共线性分析,高粱,线性特征,倍性,转录组数据,表达模式分析,双重胁迫,胁迫处理,表达方式,胁迫响应
AB值:
0.334825
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