典型文献
闽楠NF-Y基因家族鉴定及其响应干旱胁迫的表达分析
文献摘要:
核因子Y(nuclear factor Y,NF-Y)是一种广泛存在于真核生物中的转录因子,参与植物的生长发育以及生物和非生物胁迫响应过程.闽楠(Phoebe bournei)是我国南方重要的经济用材树种,水分匮缺严重影响其生长和木材积累,挖掘闽楠抗旱响应因子将为提高其抗旱性提供支持.本研究对闽楠NF-Y(PbNF-Y)基因家族进行全基因组鉴定和生物信息学分析,并利用qPCR技术分析PbNF-Ys的组织表达特异性及干旱胁迫下的表达模式.结果显示,在闽楠全基因组范围内共鉴定出40个PbNF-Y,分为3个亚家族,不均匀分布于11条染色体;PbNF-Ys蛋白分子质量在10774.45(PbNF-YB11)~39576.26 D(PbNF-YA2)之间,均为亲水性蛋白;启动子顺式作用元件分析发现,PbNF-Ys启动子区域存在生长素、赤霉素及茉莉酸甲酯等激素响应元件、光响应元件、生长发育相关响应元件和干旱胁迫相关元件;采用qPCR方法对根、茎和叶片进行组织表达分析,结果显示,PbNF-Ys的表达具有明显的组织特异性.干旱胁迫后表达模式分析发现,17个PbNF-Y在干旱胁迫后表现不同程度的上调表达,16个PbNF-Y表达下调,7个PbNF-Y表达没有显著变化.本研究为闽楠NF-Y基因家族生物学功能和进化的深入研究提供参考依据.
文献关键词:
闽楠;NF-Y转录因子;基因家族;表达分析;抗旱
中图分类号:
作者姓名:
韩双;韩潇;李翼贝;张毓婷;张俊红;童再康
作者机构:
浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室,杭州311300
文献出处:
引用格式:
[1]韩双;韩潇;李翼贝;张毓婷;张俊红;童再康-.闽楠NF-Y基因家族鉴定及其响应干旱胁迫的表达分析)[J].农业生物技术学报,2022(06):1112-1127
A类:
PbNF,Ys,YB11,YA2
B类:
闽楠,基因家族鉴定,干旱胁迫,核因子,nuclear,真核生物,非生物胁迫,胁迫响应,响应过程,Phoebe,bournei,用材树种,匮缺,木材,材积,抗旱性,全基因组鉴定,生物信息学分析,qPCR,达特,亚家族,不均匀分布,分子质量,亲水性,顺式作用元件,启动子区域,生长素,赤霉素,茉莉酸甲酯,激素响应,响应元,光响应,关元,组织表达分析,组织特异性,表达模式分析,生物学功能
AB值:
0.239869
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