典型文献
青稞新基因HvMEL1 AGO的克隆和条纹病胁迫下的表达
文献摘要：
为筛选与青稞条纹病相关的AGO类基因,本研究以青稞抗病品种昆仑14号和感病品种1141为材料,从感病和正常叶片的转录组测序结果中获得一个差异表达的AGO家族新基因,克隆验证了该基因为青稞HvMEL1 AGO.HvMEL1 AGO基因全长3462 bp,其中蛋白质编码区(CDS,coding domain sequence)在昆仑14号和1141品种中的一致性为100％,无内含子,全长3161 bp,包含一个3129 bp开放阅读框,编码1043个氨基酸,理论等电点为9.33,预测蛋白分子量为115,865.58 Da.蛋白质序列分析表明,HvMEL1 AGO为亲水性的不稳定酸性蛋白,具有高度保守的DUF1785、PAZ和PIWI结构域,属于AGO基因家族成员.进化树分析表明,HvMEL1 AGO与大麦AGO家族中HvAGO12、HvAGO18、HvAGO1D、HvAGO1B在拟南芥AGO家族系统发育树上属于AGO1一类;与HvAGO12的亲缘关系最近.蛋白质互作预测结果表明,在水稻中与MEL1作用密切的已知蛋白为DCL类,分别为DCL1、DCL2A、DCL3A、DCL3B和DCL4.半定量和定量PCR结果表明,条纹病胁迫下,抗病品种昆仑14号与感病品种1141的HvMEL1 AGO基因表达量显著下降;且1141显著高于昆仑14号(P<0.01).推测青稞HvMEL1 AGO基因在青稞抗条纹病过程中发挥重要作用.本研究为探索HvMEL1 AGO基因在青稞抗条纹病过程中的作用及调控机制奠定基础.
文献关键词：
青稞;条纹病;HvMEL1 AGO基因;基因表达
中图分类号：
作者姓名：
姚晓华;王越;姚有华;安立昆;王燕;吴昆仑
作者机构：
青海大学,青海西宁 810016;青海省农林科学院 / 青海省青稞遗传育种重点实验室 / 国家麦类改良中心青海青稞分中心,青海西宁 810016
文献出处：
引用格式：
[1]姚晓华;王越;姚有华;安立昆;王燕;吴昆仑-.青稞新基因HvMEL1 AGO的克隆和条纹病胁迫下的表达)[J].作物学报,2022(05):1181-1190
A类：
HvMEL1,DUF1785,HvAGO12,HvAGO18,HvAGO1D,HvAGO1B,DCL1,DCL2A,DCL3A,DCL3B,DCL4
B类：
青稞,新基因,条纹病,胁迫,抗病品种,昆仑,转录组测序,差异表达,全长,bp,编码区,CDS,coding,domain,sequence,内含子,开放阅读框,等电点,分子量,Da,蛋白质序列,序列分析,亲水性,PAZ,PIWI,结构域,基因家族,进化树分析,大麦,拟南芥,族系,系统发育树,树上,亲缘关系,水稻,半定量,基因表达量,调控机制
AB值：
0.21045
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