典型文献
新疆两种亚麻籽转录组分析及籽油香气差异基因挖掘
文献摘要：
为丰富亚麻籽转录组数据信息,在分子水平上探究不同品种亚麻籽所得亚麻籽油的香气差异原因,本研究选择2种新疆特色亚麻籽(伊亚-3号和天亚-6号),通过Illumina高通量测序平台对其进行转录组测序,并通过多种生物信息学方法对数据进行统计分析.结果 表明:共获得61995756条高质量的clean reads,将测序数据进行de novo组装得到33218个unigene;非冗余蛋白(Non-Redundant Protein,NR)数据库注释发现亚麻籽转录组与麻风树相似序列最高,有17269个unigene在直系同源群集(Cluster of Orthologous Group,COG)数据库中注释到,分为细胞过程和信号、信息存储与处理、代谢3大类22个分支;两组样品分析显示有1658个显著性差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),伊亚-3号相较于天亚-6号亚麻籽样品共有825个基因上调表达,833个基因下调表达,将DEGs在基因本体数据库中注释显示,两个品种在生物过程、细胞组分和分子功能3大类分布.注释到京都基因与基因组百科全书数据库的380个DEGs,主要富集到脂肪酸代谢等代谢途径,且脂肪酸代谢通路中可注释到17个DEGs,其中不饱和脂肪酸代谢通路中可注释到8个DEGs.本研究可为新疆不同品种亚麻籽油的香气差异分析提供理论依据和技术支撑.
文献关键词：
亚麻籽;转录组;差异表达基因;功能注释
中图分类号：
作者姓名：
杨佳玮;李欢康;林雨霏;刘文玉;魏长庆
作者机构：
石河子大学食品学院,新疆植物药资源利用教育部重点实验室,新疆石河子 832000
文献出处：
引用格式：
[1]杨佳玮;李欢康;林雨霏;刘文玉;魏长庆-.新疆两种亚麻籽转录组分析及籽油香气差异基因挖掘)[J].食品科学,2022(02):70-76
A类：
B类：
转录组分析,油香,香气,差异基因,基因挖掘,转录组数据,分子水平,不同品种,亚麻籽油,差异原因,Illumina,高通量测序平台,转录组测序,生物信息学方法,共获,clean,reads,序数,de,novo,装得,unigene,非冗余,Non,Redundant,Protein,NR,麻风树,直系,群集,Cluster,Orthologous,Group,COG,信息存储,样品分析,差异表达基因,differentially,expressed,genes,DEGs,基因本体,生物过程,京都基因与基因组百科全书,脂肪酸代谢,代谢途径,代谢通路,不饱和脂肪酸,功能注释
AB值：
0.368292
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