典型文献
羧甲基纤维素诱导培养下罗伦隐球酵母的转录组差异分析
文献摘要：
为探究罗伦隐球酵母(Cryptococcus laurentii)响应羧甲基纤维素(carboxymethyl cellulose,CMC)诱导培养的分子机理,为多糖诱导C.laurentii生理代谢相关基因的挖掘提供理论依据.该实验以不加CMC培养的C.laurentii为对照组,加0.5％(质量分数)CMC培养的C.laurentii为处理组(0.5％CMC),观察了CMC诱导培养对C.laurentii细胞生长形态变化.在此基础上,通过Illumina高通量测序技术,对2组酵母菌进行转录组测序,并采用生物信息学方法对数据分析.结果表明,添加0.5％(质量分数)CMC培养后,部分酵母细胞形态呈椭圆形,0.5％CMC诱导培养24～72 h,酵母细胞形态变化率显著(P<0.05)高于对照组.转录组数据分析表明,CMC诱导培养24 h,C.laurentii共有58个差异基因(differential genes,DEGs),其中55个为上调表达,3个为下调表达.DEGs被注释到24条GO(gene ontology)分类中和14条KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Ge-nomes)通路中,分析结果表明,0.5％CMC诱导培养24 h C.laurentii涉及的DEGs功能主要与细胞能量代谢和生长、繁殖等有关.上述结果可以为多糖诱导培养对C.laurentii的生长影响及提高酵母拮抗效力分子机制的进一步研究提供科学依据,其可为C.laurentii形态变化相关基因挖掘提供理论基础,并为今后C.laurentii的商业化应用提供了一定的现实指导意义.
文献关键词：
罗伦隐球酵母;羧甲基纤维素;转录组;诱导;生物学信息分析
中图分类号：
作者姓名：
马电通;常雪苗;李文清;黄二宾;杜嵘宇;杨清;王芳;邓佳
作者机构：
西南林业大学 林学院,云南 昆明,650224;西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室,云南 昆明,650224;西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室,云南 昆明,650224
文献出处：
引用格式：
[1]马电通;常雪苗;李文清;黄二宾;杜嵘宇;杨清;王芳;邓佳-.羧甲基纤维素诱导培养下罗伦隐球酵母的转录组差异分析)[J].食品与发酵工业,2022(08):55-63
A类：
laurentii
B类：
羧甲基纤维素,诱导培养,罗伦隐球酵母,转录组差异分析,Cryptococcus,carboxymethyl,cellulose,CMC,分子机理,生理代谢,代谢相关基因,不加,细胞生长,生长形态,形态变化,Illumina,高通量测序技术,酵母菌,转录组测序,生物信息学方法,酵母细胞,细胞形态,椭圆形,转录组数据,差异基因,differential,genes,DEGs,ontology,Kyoto,Encyclopedia,Genes,nomes,细胞能量代谢,生长影响,基因挖掘,商业化应用,生物学信息分析
AB值：
0.279607
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