典型文献
三种miRNA对肝癌预后预测的生物信息学分析模型
文献摘要：
目的 通过TCGA数据库构建一种miRNA预后模型,预测肝癌的预后.方法 通过edgeR软件包对miRNA和mRNA的表达数据进行分析和标准化,并与生存率相结合分为两组.通过单因素和多因素Cox回归分析构建3种与总生存率明显差异相关的miRNA,使用ROC曲线评价其可靠性.通过miRDB、TargetScan和miR TarBase 3个数据库筛选出miRNA的靶基因,并运用GO和KEGG探究其相关作用机制.使用Cytoscape3.7.2和String数据库筛选出前10个中枢基因.结果 共筛选出47个靶基因与生存预后显著相关;ROC曲线结果显示,三组的AUC分别为0.789、0.730、0.763,说明模型预测HCC患者预后的能力;回归分析显示,该模型可独立影响肿瘤的预后情况,包括T分期、临床分期及远处转移的存在.结论 has-miR-3682-3p、has-miR-9-5p和has-miR-139-5p三种miRNA的生物学分析模型可以预测HCC患者的预后,且可以作为HCC中独立的预后因素.
文献关键词：
肝细胞癌;microRNA;预后;TCGA
中图分类号：
作者姓名：
林思其;张泽鑫;夏睿琪;刘紫凤;陈林静;陈栩静;陈祎琦
作者机构：
广州中医药大学第二临床医学院,广东 广州510405;广州中医药大学第一临床医学院,广东 广州510405
文献出处：
引用格式：
[1]林思其;张泽鑫;夏睿琪;刘紫凤;陈林静;陈栩静;陈祎琦-.三种miRNA对肝癌预后预测的生物信息学分析模型)[J].医学信息,2022(03):81-85
A类：
B类：
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AB值：
0.425349
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