典型文献
斑马鱼肌肉高表达基因近端非编码元件分析及功能检测
文献摘要：
为鉴定鱼类肌肉组织特异性顺式调控元件,通过分析斑马鱼多个组织的转录组数据,筛选出肌肉高表达基因及低表达基因.通过MEME对肌肉高表达基因和低表达基因非编码区序列特征进行分析,在5个肌肉高表达基因的转录起始位点上游发现了序列保守的DNA区域,包含6个排列顺序一致的DNA基序.将其中一段目标片段插入具有Tol2转座子元件的基础启动子驱动的eGFP编码基因的上游,构建表达载体.注射载体至斑马鱼受精卵获得转基因胚胎,分析胚胎中eGFP荧光的表达模式,发现该DNA片段具有增强基因在肌肉特异性表达的功能.Tomtom预测该DNA区域可能作为Myod等多个转录因子的结合位点.研究结果有助于理解鱼类肌肉基因表达的遗传基础,并为利用生物信息学方法预测组织特异性转录调控元件提供新思路.
文献关键词：
顺式调控元件;肌肉;基因表达;斑马鱼
中图分类号：
作者姓名：
鲁程成;赵一凡;范纯新;王建
作者机构：
上海海洋大学国家海洋生物科学国际联合研究中心, 上海 201306;上海海洋大学国际海洋研究中心海洋生物系统与神经科学研究所, 上海 201306;上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室, 上海 201306
文献出处：
引用格式：
[1]鲁程成;赵一凡;范纯新;王建-.斑马鱼肌肉高表达基因近端非编码元件分析及功能检测)[J].水生生物学报,2022(03):292-302
A类：
Tol2,Tomtom
B类：
斑马鱼,高表达基因,近端,码元,鱼类肌肉,肌肉组织,组织特异性,顺式调控元件,转录组数据,低表达,MEME,非编码区,序列特征,转录起始位点,排列顺序,基序,转座子,启动子,eGFP,编码基因,建表,表达载体,受精卵,转基因,表达模式,特异性表达,Myod,结合位点,遗传基础,利用生物,生物信息学方法,转录调控元件
AB值：
0.318442
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