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典型文献
显微介导中国对虾基因鲤转录组测序及差异表达基因分析
文献摘要:
运用显微介导的远缘杂交技术,将中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)总DNA直接导人鲤(Cyprinuscarpio)受精卵内,创建鲤外源DNA导入系.利用Illumina高通量测序平台,对未进行显微介导和显微介导中国明对虾基因的2种鲤的肌肉组织进行转录组测序分析,结果获得差异表达基因417个,并对其进行GO(Gene Ontology)功能注释和KEGG代谢通路注释,得到18个与氨基酸相关的差异表达基因,其中14个下调基因,4个上调基因.分析发现,其中有2个基因在氨基酸代谢通路中能引起氨基酸含量的升高,即氨甲酰-磷酸合成酶(CPS2)基因和脯氨酰4-羟化酶(P4H)基因.对这2个基因进行实时荧光定量PCR验证发现,其基因的表达趋势与转录组结果一致,从而证实了转录组的分析结果.
文献关键词:
显微介导;中国对虾总DNA;转录组测序;差异表达基因
作者姓名:
闫学春;栾培贤;何立川
作者机构:
中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,淡水鱼类育种国家地方联合工程实验室,农业农村部淡水水产生物技术与遗传育种重点实验室,黑龙江 哈尔滨 150070
文献出处:
引用格式:
[1]闫学春;栾培贤;何立川-.显微介导中国对虾基因鲤转录组测序及差异表达基因分析)[J].水产学杂志,2022(05):1-7
A类:
显微介导,CPS2
B类:
中国对虾,差异表达基因分析,远缘杂交,杂交技术,中国明对虾,Fenneropenaeus,chinensis,Cyprinuscarpio,受精卵,导入系,Illumina,高通量测序平台,肌肉组织,转录组测序分析,Gene,Ontology,功能注释,代谢通路,氨基酸代谢,氨基酸含量,甲酰,合成酶,脯氨,羟化酶,P4H
AB值:
0.296106
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