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典型文献
红耳龟性别分化相关基因的筛选与分析
文献摘要:
温度依赖型性别决定(temperature-dependent sex determination,TSD)是一种奇特的表型可塑性现象,但其背后的分子机制尚不清楚.红耳龟(Trachemysscripta)是一种典型TSD动物,个体性别完全由胚胎发育时所处的环境温度决定.为提供更多能够解释TSD机制的基础数据,选取红耳龟第16期产雄温度(male-producing temperature,MPT)和产雌温度(female-producing temperature,FPT)性腺,采用 IlluminaHiseq 2500高通量平台进行转录组测序,筛选出雌雄差异表达基因474个,其中,MPT高表达基因283个,FPT高表达基因191个.通过与NR、Swiss-Prot、GO、COG、KOG、KEGG数据库进行比对,获得60个GO功能注释分类和139条KEGG代谢通路.根据差异表达基因的功能注释分析发现:参与红耳龟性别决定和分化的候选基因,包括Dmrtl、Sox9、Foxl2等高度保守的性别分化基因,Cyp11b1、Hsd11b2等类固醇激素代谢相关基因,以及Hspb6、Dnaja4、Serpinhl等热敏性蛋白编码基因.最后,通过荧光定量PCR和免疫荧光染色对部分候选基因进行表达验证,与转录组结果相一致.该研究挖掘了一些新的温度响应因子和激素代谢相关因子,为破译红耳龟TSD分子机制提供了基础.
文献关键词:
红耳龟;转录组;温度依赖型性别决定(TSD);性腺分化
作者姓名:
刘芳;马晓慧;孙伟;钱国英;葛楚天
作者机构:
浙江万里学院生物与环境学院,浙江宁波 315100;上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心,上海201306
引用格式:
[1]刘芳;马晓慧;孙伟;钱国英;葛楚天-.红耳龟性别分化相关基因的筛选与分析)[J].上海海洋大学学报,2022(01):39-51
A类:
性别分化相关基因,温度依赖型性别决定,Trachemysscripta,IlluminaHiseq,Dmrtl,Cyp11b1,Hsd11b2,Hspb6,Dnaja4,Serpinhl
B类:
红耳龟,temperature,dependent,sex,determination,TSD,奇特,表型可塑性,个体性,全由,胚胎发育,producing,MPT,female,FPT,转录组测序,雌雄差异,差异表达基因,高表达基因,NR,Swiss,Prot,COG,KOG,功能注释,代谢通路,候选基因,Sox9,Foxl2,类固醇激素,激素代谢,代谢相关基因,热敏性,蛋白编码,编码基因,免疫荧光染色,相一致,温度响应,相关因子,破译,性腺分化
AB值:
0.308893
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