典型文献
罗氏沼虾组织和性别特异性表达基因的挖掘研究
文献摘要:
为挖掘罗氏沼虾消化和性别决定主要器官发育规律及个体器官成熟标记(Marker),利用组织特性参数(τ)等分析技术,对性成熟罗氏沼虾的消化和性别决定关键组织器官(眼柄、肝胰腺、精巢、促雄性腺和卵巢)进行转录组表达分析研究.结果表明,5个器官组织的组织特异性高表达基因数依次分别为1874,2700,1698,270和4216个;以τ≥0.85为条件,鉴定获得组织特异性高表达基因数依次分别为864,1421,1550,254和4457个;以τ≥1为条件,鉴定获得组织唯一高表达基因数依次分别为33,29,39,5和729个.5个器官组织唯一表达量最高基因的KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)功能研究表明,视紫红质、抗原样蛋白E异构体、rho鸟嘌呤核苷酸交换因子7、四域蛋白酶类抑制剂和血细胞素异构体X2分别在5个组织中显著高表达,且与组织功能显著相关,分别具有成为5个器官组织发育成熟标记(Marker)的特征.发现雄性特异高表达基因162个和雌性特异高表达基因293个,在雄性和雌性中均发现性别特异性,且各组织均匀稳定表达基因KEGG功能分别注释为假设蛋白和核糖体蛋白L28,且二者相对表达量在同性不同组织间变异系数均<0.5,具有作为罗氏沼虾性别发育成熟标记(Marker)的特征.
文献关键词:
罗氏沼虾;组织特异性;性别特异基因;组织特异性参数
中图分类号:
作者姓名:
任晋东;陈红林;牛宝龙;詹炜;楼宝
作者机构:
浙江省农业科学院水生生物研究所,浙江 杭州 310021
文献出处:
引用格式:
[1]任晋东;陈红林;牛宝龙;詹炜;楼宝-.罗氏沼虾组织和性别特异性表达基因的挖掘研究)[J].水产养殖,2022(08):1-7,71
A类:
性别特异基因,组织特异性参数
B类:
罗氏沼虾,性别特异性,特异性表达,性别决定,器官发育,发育规律,Marker,组织特性,特性参数,性成熟,组织器官,眼柄,肝胰腺,精巢,性腺,转录组,表达分析,高表达基因,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,功能研究,视紫红质,原样,异构体,rho,鸟嘌呤,酶类,血细胞,X2,组织功能,别具,发育成,雄性特异,雌性,组织均匀,稳定表达,核糖体蛋白,L28,相对表达量,不同组织
AB值:
0.338699
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