典型文献
低氧胁迫下斑马鱼鳃microRNAs差异分析
文献摘要：
为研究microRNAs(miRNAs)应对低氧胁迫的生物学功能,对低氧胁迫和常氧条件下斑马鱼(Danio rerio)鳃组织进行高通量miRNAs测序,分析了低氧胁迫与常氧条件下斑马鱼鳃中miRNAs的表达差异.结果表明,低氧胁迫和常氧条件下,斑马鱼鳃中共有15个miRNAs呈显著差异表达,其中13个miRNAs在低氧胁迫斑马鱼鳃中的表达量显著上调,2个miRNAs表达量显著下调.对miRNAs测序和斑马鱼鳃转录组进行关联分析,针对前期筛选获得的低氧胁迫与常氧条件下显著差异表达的28个热休克蛋白基因进行靶基因预测,结果显示,低氧胁迫下显著低表达的miR-455-3p同时靶向提高热休克蛋白基因hspa14和dnajb6b的表达,以增强对低氧的适应能力.另外,低氧胁迫下显著高表达的miR-194a和miR-155可以分别靶向5个热休克蛋白基因(hspa12a,dnajc5aa,hspb7,hsp70.3,dnajb2)和4个热休克蛋白基因(hspa12a,hspg2,hspa13,dnajb2)来调控斑马鱼对低氧环境的适应.
文献关键词：
斑马鱼;miRNAs;高通量测序;热休克蛋白基因;靶基因预测
中图分类号：
作者姓名：
林枫;贾若南;王法祥;许强华
作者机构：
上海海洋大学海洋科学学院,上海201306;上海海洋大学/大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室/国家远洋渔业工程技术研究中心/远洋渔业协同创新中心,上海201306
文献出处：
引用格式：
[1]林枫;贾若南;王法祥;许强华-.低氧胁迫下斑马鱼鳃microRNAs差异分析)[J].南方水产科学,2022(03):86-93
A类：
hspa14,dnajb6b,194a,hspa12a,dnajc5aa,hspb7,dnajb2,hspg2,hspa13
B类：
低氧胁迫,斑马鱼,鱼鳃,microRNAs,miRNAs,生物学功能,常氧,Danio,rerio,表达差异,差异表达,转录组,热休克蛋白基因,靶基因预测,低表达,3p,高热,hsp70,低氧环境
AB值：
0.150107
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