典型文献
棘头梅童鱼肝型脂肪酸结合蛋白基因克隆及组织表达分析
文献摘要:
为进一步了解肝型脂肪酸结合蛋白基因(L-FABP基因)在棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)营养调控、脂肪酸代谢和免疫应答等方面的功能作用,以棘头梅童鱼全基因组组装数据为基础,获得L-FABP基因的含开放阅读框的cDNA序列,利用生物信息学方法分析编码的蛋白质结构及进化关系,采用荧光定量(qRT-PCR)技术研究了不同组织中L-FABP基因的表达情况.结果表明,L-FABP基因cDNA序列为475 bp,其中5'非翻译区为51 bp,3'非翻译区为40 bp,开放阅读框为384 bp,编码127个氨基酸.其结构由10个β-折叠链和2个α-螺旋链组成,在氨基酸3~126位点间具有保守的脂质/胞质性脂肪酸结合结构域.棘头梅童鱼L-FABP基因与大黄鱼、条纹狼鲈同源性较近,与绿河鲀、尼罗罗非鱼和斑马鱼同源性较远.L-FABP基因在棘头梅童鱼肝脏、肠道、眼、大脑、心脏、肌肉、胃、鳃、脾脏、头肾和中肾中均有表达,其中肝脏中的L-FABP相对表达量最高,显著高于其他组织(P<0.05).
文献关键词:
棘头梅童鱼;肝型脂肪酸结合蛋白;基因克隆;组织表达
中图分类号:
作者姓名:
欧阳文杰;宋炜;陈佳;桂福坤;程家骅;谢正丽;冯广朋
作者机构:
浙江海洋大学,国家海洋设施养殖工程技术研究中心,浙江舟山 316022;中国水产科学研究院东海水产研究所,农业农村部远洋与极地渔业创新重点实验室,上海 200090;福建福鼎海鸥水产食品有限公司,大黄鱼育种国家重点实验室,福建宁德 352103;中国水产科学研究院渔业机械仪器研究所,农业农村部渔业装备与工程技术重点实验室,上海 200092
文献出处:
引用格式:
[1]欧阳文杰;宋炜;陈佳;桂福坤;程家骅;谢正丽;冯广朋-.棘头梅童鱼肝型脂肪酸结合蛋白基因克隆及组织表达分析)[J].水产科技情报,2022(06):317-324
A类:
B类:
棘头梅童鱼,鱼肝,肝型脂肪酸结合蛋白,基因克隆,组织表达分析,FABP,Collichthys,lucidus,营养调控,脂肪酸代谢,免疫应答,功能作用,全基因组,基因组组装,开放阅读框,cDNA,利用生物,生物信息学方法,蛋白质结构,进化关系,qRT,不同组织,bp,翻译区,折叠,结合结构,结构域,大黄鱼,条纹,同源性,河鲀,尼罗罗非鱼,斑马鱼,较远,脾脏,头肾,相对表达量,他组织
AB值:
0.326506
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