典型文献
鲑降钙素对虹鳟鳞组织lncRNA表达的影响
文献摘要：
为探明鲑降钙素(salmon calcitonin,sCT)对鱼类骨组织钙代谢过程的调节机制,对虹鳟(Oncorhynchus mykiss)幼鱼进行sCT腹腔注射,并在注射后24 h采集鳞组织进行转录组测序,分析其中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表达水平的变化.结果显示,注射sCT后的虹鳟鳞组织中共鉴定出847个差异表达的lncRNA,其中247个表达上调,600个表达下调.GO注释结果显示,差异表达lncRNA靶基因主要被注释到转录调控、运输、信号转导、膜、细胞质、金属离子结合和核苷酸结合等功能中.KEGG通路富集结果显示,差异表达lncRNA靶基因在硫胺素代谢通路、炎症介质对TRP通道调节、血小板活化、谷氨酸能突触、神经营养因子通路、ARVC通路和NF-kappa B信号通路等通路中显著富集.利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)对随机选取的6个差异表达lncRNA的表达量进行验证,结果显示,qRT-PCR与RNA-Seq结果一致.基于上述结果,本研究筛选到 MSTRG.68909.2、MSTRG.39805.1、MSTRG.121429.1、MSTRG.9137.1 和 MSTRG.43721.1 共 5 个可能参与虹鳟钙代谢的关键lncRNA,这些关键基因的筛选鉴别可为探明硬骨鱼类骨代谢的调控机理提供新的切入点,为虹鳟养殖生产实践提供参考.
文献关键词：
虹鳟;钙代谢;长链非编码RNA;转录组;鳞
中图分类号：
作者姓名：
王刘永;周启苓;马骞;毛非凡;杨二军;陈刚
作者机构：
广东海洋大学水产学院,广东湛江524025;南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江),广东湛江524025
文献出处：
引用格式：
[1]王刘永;周启苓;马骞;毛非凡;杨二军;陈刚-.鲑降钙素对虹鳟鳞组织lncRNA表达的影响)[J].中国水产科学,2022(07):1091-1100
A类：
sCT
B类：
鲑降钙素,虹鳟,lncRNA,salmon,calcitonin,骨组织,钙代谢,代谢过程,调节机制,Oncorhynchus,mykiss,幼鱼,腹腔注射,转录组测序,长链非编码,long,coding,差异表达,靶基因,转录调控,信号转导,细胞质,金属离子,离子结合,通路富集,集结,硫胺素,代谢通路,炎症介质,TRP,血小板活化,谷氨酸能突触,神经营养因子,ARVC,kappa,quantitative,real,qRT,Seq,MSTRG,关键基因,硬骨鱼类,骨代谢,调控机理,生产实践
AB值：
0.354157
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