典型文献
不同生长速率花鲈肌肉转录组分析及生长相关基因筛选
文献摘要：
[目的]筛选与花鲈肌肉生长相关的基因和信号通路,为揭示花鲈肌肉生长发育的遗传机制提供理论依据.[方法]分别取4尾生长快速[体长(34.22±2.53)cm]和4尾生长慢速[体长(17.46±1.78)cm]的花鲈个体肌肉进行转录组测序.用DESeq2 R软件包筛选差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),对DEGs进行GO富集和KEGG富集分析.通过实时荧光定量PCR验证转录组数据的准确性.[结果与结论]测序原始数据经过质量控制和组装共得到137960个unigenes,其中68334个unigenes在Nr中注释成功.获得10552个DEGs,其中2064个DEGs表达量上调,8488个DEGs表达量下调,鉴定出胰岛素样生长因子结合蛋白1基因(IGFBP1)、纤维细胞生长因子基因(FGF)、肌肉生长抑制素基因(MSTN)、生长激素受体1基因(GHR1)等与肌肉生长发育相关的基因.DEGs的GO富集结果显示,与物质和能量代谢相关的条目差异显著.KEGG富集结果显示,糖酵解/合成、腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)、脂肪酸降解、精氨酸和脯氨酸代谢等信号通路与肌肉生长密切相关.
文献关键词：
花鲈;转录组;差异表达基因;GO富集;KEGG富集
中图分类号：
作者姓名：
范嗣刚;杨文燕;黄皓;王鹏飞;赵超;闫路路;张博;邱丽华
作者机构：
中国水产科学研究院南海水产研究所/广东省渔业生态环境重点实验室,广东 广州 510300;广东省农业技术推广中心,广东 广州 510520;上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306
文献出处：
引用格式：
[1]范嗣刚;杨文燕;黄皓;王鹏飞;赵超;闫路路;张博;邱丽华-.不同生长速率花鲈肌肉转录组分析及生长相关基因筛选)[J].广东海洋大学学报,2022(05):9-17
A类：
GHR1
B类：
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AB值：
0.321754
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