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红望天眼金鱼皮肤变色机制的转录组学分析
文献摘要：
为了探索红望天眼金鱼Carassius auratus的变色机制,采用RNA-Seq高通量测序技术,对红望天眼金鱼(145日龄,体长6 cm)由灰色、过渡色到橙红色3个变色阶段进行了转录组学分析.结果表明:共得到过滤后碱基量57.8 Gb,构建了新转录本并预测新基因1629个,在两两组比较的差异表达基因群中分析出3个变色组共有差异表达基因25个;差异表达基因的GO功能富集和KEGG通路富集分析显示,差异基因主要富集到免疫反应、细胞增殖与凋亡和黑色素等相关通路;根据转录组比较分析结果和实际生产经验观察积累,初步推测红望天眼金鱼变色的生理机制是红望天眼金鱼变色初期黑色素细胞大量增殖,期间发生免疫炎症反应,随后黑色素细胞开始逐渐凋亡,同时其他色素细胞则逐渐增殖分化,直至完全取代黑色素细胞,完成变色过程.本研究初步分析出了红望天眼金鱼的皮肤变色机制,研究结果可为进一步开展调控金鱼变色的功能基因试验和金鱼变色的分子机理研究提供科学参考.
文献关键词：
红望天眼金鱼;体色变迁;转录组测序;差异表达基因;信号通路
中图分类号：
作者姓名：
李荣妮;王赛赛;田仲;孙砚胜;张博;张欣
作者机构：
北京市农林科学院 国家淡水渔业工程技术研究中心,北京100068;渔业生物重点实验室,北京 100097;中国农业大学动物科技学院,北京100193
文献出处：
引用格式：
[1]李荣妮;王赛赛;田仲;孙砚胜;张博;张欣-.红望天眼金鱼皮肤变色机制的转录组学分析)[J].大连海洋大学学报,2022(02):191-201
A类：
红望天眼金鱼,望天眼金鱼,体色变迁
B类：
鱼皮,变色,转录组学分析,Carassius,auratus,Seq,高通量测序技术,日龄,体长,橙红色,碱基,Gb,新转录本,新基因,差异表达基因,功能富集,通路富集分析,差异基因,免疫反应,细胞增殖与凋亡,相关通路,经验观察,生理机制,黑色素细胞,免疫炎症反应,增殖分化,初步分析,功能基因,分子机理,转录组测序
AB值：
0.196945
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