为了了解野生型和长鳍突变型四带小鲃的体长、尾鳍长、尾鳍分节数目和分节长度,实验利用转录组学方法和t检验统计方法对上述指标进行了分析.结果显示,6月龄野生型(n=30)与突变型(n=30)成鱼体长之间没有显著差异,但二者尾鳍长、尾鳍分节数目和分节长度3个指标间存在显著差异.同时,对不同体长野生型(n=80)和突变型(n=80)四带小鲃尾鳍长度、分节数目和分节长度进行了线性回归分析.结果显示,相对于野生型,突变型四带小鲃尾鳍长度增加速率更快(野生型:k=0.28,突变型:k=0.62),尾鳍分节数目增加频率基本一致(野生型:k=0.79,突变型:k=0.82),尾鳍分节长度更长(野生型:k=0.0004,突变型:k=0.0068).野生型和突变型成鱼尾鳍组织的转录组分析结果显示,转录组从头组装共获得56271个unigene,野生型组(n=3)和突变型组(n=3)之间共有1304个差异表达基因,其中971个基因上调,333个基因下调.差异表达基因KEGG通路显著富集到细胞周期和DNA复制等与细胞增殖相关的信号通路,其中细胞周期蛋白基因(cycA、cycB和cycE)和细胞周期依赖性激酶基因(cdk1)等显著上调.最后,对ckap2l、ki-67、cdc20、prc1、urgcp和cdk1共6个基因的表达水平进行了实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析,其结果与转录组分析结果基本一致.研究表明,长鳍四带小鲃突变基因引起细胞周期相关基因表达量上升,造成尾鳍分节片段的细胞增殖速率加快,尾鳍分节长度增加,呈现为长尾鳍表型.

四带小鲃;长鳍突变型;尾鳍;转录组测序;差异表达基因;细胞增殖

杨继辉;燕男;崔文耀;熊加奉;黄嵘;任建峰

上海海洋大学,科技部海洋生物科学国际联合研究中心,上海 201306;上海海洋大学,水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海 201306;广东省水族协会,广东 广州 510375

水产学报

[1]杨继辉;燕男;崔文耀;熊加奉;黄嵘;任建峰-.四带小鲃的长鳍表型及其转录组分析)[J].水产学报,2022(08):1324-1333

四带小鲃,长鳍突变型,尾鳍组织,cycA,cycB,cycE,cdk1,ckap2l,cdc20,prc1,urgcp

转录组分析,了了,野生型,分节,节数,节长,转录组学,统计方法,月龄,成鱼,鱼体,不同体长,长野,鱼尾,从头组装,共获,unigene,差异表达基因,细胞周期蛋白,酶基因,ki,qRT,突变基因,相关基因表达,基因表达量,节片,长尾,转录组测序

0.158123