典型文献
豹纹鳃棘鲈差异流速下肝脏转录组分析
文献摘要：
水流速度是影响鱼类生长的重要环境因子之一.为探究豹纹鳃棘鲈(Plectropomus leopardus)在不同流速条件下相关基因的功能和表达情况,利用RNA-Seq技术对差异流速下的豹纹鳃棘鲈肝脏组织进行了转录组分析.挑选相同繁育批次中规格一致的豹纹鳃棘鲈幼苗,分别在正常流速(0.1 m·s?1,Low flow velocity,LFV)和高流速(0.4 m·s?1,High flow velocity,HFV)实验组中养殖150 d后进行肝脏转录组测序分析,探究豹纹鳃棘鲈在差异流速下个体间的基因表达模式差异.结果显示,经筛选后共获得1977个LFV-HFV显著性差异表达基因(Differentially expressed genes,DGE),其中上调基因999个,下调基因978个.GO功能注释分类发现,共有1124个DEGs被GO数据库注释到并归属为56个功能类别.KEGG富集分析结果显示,573个DEGs参与了154条KEGG通路,其中富集最显著的为PPAR信号通路.LFV和HFV两组鱼的肝脏组织学观察结果显示,两者之间脂肪含量差异明显,LFV组肝脏中的脂肪含量显著高于HFV组(P<0.05).通过转录组分析,筛选了大量豹纹鳃棘鲈差异流速下的DGEs,为深入探讨豹纹鳃棘鲈对流速变化适应性的分子调控机制提供了技术支撑.
文献关键词：
豹纹鳃棘鲈;差异流速;转录组分析
中图分类号：
作者姓名：
高进;王永波;刘金叶;郭一兰;符书源
作者机构：
海南热带海洋学院/热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室,海南 三亚 572022;海南省海洋与渔业科学院,海南 海口 571126;海南省热带海水养殖工程技术研究中心,海南 海口 571126
文献出处：
引用格式：
[1]高进;王永波;刘金叶;郭一兰;符书源-.豹纹鳃棘鲈差异流速下肝脏转录组分析)[J].南方水产科学,2022(01):107-117
A类：
差异流速,LFV,HFV
B类：
豹纹鳃棘鲈,肝脏转录组,转录组分析,水流速度,鱼类生长,环境因子,Plectropomus,leopardus,Seq,选相,繁育,幼苗,常流,Low,flow,velocity,高流速,High,转录组测序分析,基因表达模式,模式差异,共获,差异表达基因,Differentially,expressed,genes,功能注释,DEGs,富集分析,中富,PPAR,肝脏组织学,组织学观察,脂肪含量,含量差异,DGEs,流速变化,分子调控机制
AB值：
0.27724
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