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转录组分析揭示溶藻弧菌感染早期大黄鱼的免疫应答特征
文献摘要：
为探究大黄鱼(Larimichthys crocea)抗溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)感染的免疫应答机制,研究通过转录组测序及生物信息学分析的手段,在转录组水平分析了溶藻弧菌感染24h后大黄鱼头肾中基因表达水平的变化,共获得1903个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),其中641个上调表达基因,1262个下调表达基因.通过Gene Ontology(GO)和Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)富集分析发现,一些先天性免疫相关基因,包括补体(C1qbp、C1QL2和C7)、热休克蛋白(hspd1、hspa4、hspa5和hspa9)、抗菌肽(Hepcidin-1)、C型凝集素受体(Clec4e和MR1)、己糖激酶(hex1)、精氨酸酶(Arg-II)和线粒体翻译延伸因子(TUFM)等基因表达水平均显著上调;而许多与获得性免疫相关基因,包括T、B淋巴细胞增殖分化(FcR5和CCL17)、T细胞调控(TCRα、TCRβ、CD3ε、CD3γδ、CD3ζ、ZAP-70和ITK)及免疫球蛋白参与抗原识别(Ighv 5A、Ighv 914和Ighv XIG14)等基因表达水平均显著下调.结果表明,在感染早期,大黄鱼先天性免疫在抵御溶藻弧菌感染中发挥重要作用,而此时获得性免疫受到了抑制.
文献关键词：
溶藻弧菌;头肾;转录组;免疫应答;大黄鱼
中图分类号：
作者姓名：
程安怡;王永阳;翁华松;陈新华;张伟妮
作者机构：
福建农林大学海洋研究院,福建省海洋生物技术重点实验室,福州 350002;福建农林大学,中西兽医结合与动物保健福建省高校重点实验室,福州 350002;宁德富发水产有限公司,宁德 352100
文献出处：
引用格式：
[1]程安怡;王永阳;翁华松;陈新华;张伟妮-.转录组分析揭示溶藻弧菌感染早期大黄鱼的免疫应答特征)[J].水生生物学报,2022(12):1845-1854
A类：
C1qbp,C1QL2,hspd1,hspa4,hspa5,hspa9,Clec4e,hex1,TUFM,FcR5,Ighv,XIG14
B类：
转录组分析,溶藻弧菌,感染早期,大黄鱼,免疫应答,Larimichthys,crocea,Vibrio,alginolyticus,应答机制,转录组测序,生物信息学分析,水平分析,24h,鱼头,头肾,基因表达水平,共获,差异表达基因,Differentially,expressed,genes,DEGs,Gene,Ontology,Kyoto,encyclopedia,genomes,富集分析,先天性免疫,免疫相关基因,补体,C7,热休克蛋白,抗菌肽,Hepcidin,凝集素,MR1,己糖激酶,精氨酸酶,Arg,II,延伸因子,获得性免疫,淋巴细胞增殖,细胞增殖分化,CCL17,细胞调控,TCR,CD3,ZAP,ITK,免疫球蛋白,白参,抗原识别,5A
AB值：
0.352723
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