典型文献
基于转录组测序分析绿鳍马面鲀脑组织响应密度胁迫的分子机制
文献摘要：
为了解密度胁迫下,绿鳍马面鲀(Thamnaconus septentrionalis)脑组织的分子响应机制,设置两个养殖密度试验组(100尾·m-3的中密度组和500尾·m-3的高密度组)和1个对照组(密度:50尾·m-3),分别获得2个试验组绿鳍马面鲀在25 d和50 d时的脑组织样本,利用Illumina测序平台对绿鳍马面鲀脑组织样本进行转录组测序分析,得到100.3 Gb高质量测序数据.与对照组相比,各试验组均筛选出大量的差异表达基因.通过GO(Gene Ontology)功能注释与KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)功能富集分析,筛选出与昼夜节律、MAPK信号通路、钙离子信号通路相关的信号通路,发现clock、cry、bmal1、npas2、bdnf、rps6ka、il1 r1、htr5a、ryr2和pln等关键基因在不同密度下生存的绿鳍马面鲀脑组织中差异性表达.这些差异表达基因可能在调节绿鳍马面鲀的昼夜节律、免疫能力等方面发挥关键作用,研究结果可为研究该品种在密度胁迫下脑组织相关基因表达调控奠定基础.
文献关键词：
绿鳍马面鲀;转录组;密度胁迫;基因表达;脑组织
中图分类号：
作者姓名：
段晓晨;程起群
作者机构：
中国水产科学研究院东海水产研究所,上海 200090;上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306
文献出处：
引用格式：
[1]段晓晨;程起群-.基于转录组测序分析绿鳍马面鲀脑组织响应密度胁迫的分子机制)[J].海洋渔业,2022(06):725-735
A类：
密度胁迫,npas2,bdnf,rps6ka,il1,htr5a,ryr2,pln
B类：
转录组测序分析,绿鳍马面鲀,脑组织,组织响应,解密,Thamnaconus,septentrionalis,响应机制,养殖密度,密度试验,中密度,Illumina,测序平台,Gb,序数,各试,差异表达基因,Ontology,功能注释,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,功能富集分析,昼夜节律,MAPK,钙离子信号通路,clock,cry,bmal1,r1,关键基因,不同密度,差异性表达,免疫能力,该品,相关基因表达,基因表达调控
AB值：
0.34578
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