典型文献
硫酸盐还原细菌类LuxR家族调控蛋白生物信息学分析
文献摘要：
以SRB研究模式菌株Desulfovibrio vulgaris Hildenborough为研究对象,对参与生物被膜的形成、调控的群体感应系统相关基因进行分析,发现3个潜在的类LuxR家族调控因子基因citB1、citB2和citB3,对其编码的蛋白质序列进行了生物信息学分析.结果表明,citB1基因编码216个氨基酸,citB2基因编码227个氨基酸,citB3基因编码215个氨基酸,彼此之间氨基酸一致性在28.99％～37.79％.3个蛋白质序列均含有N端信号接收保守结构域和C端LuxR家族DNA结合调控保守结构域,二级结构主要为α螺旋和无规则卷曲.同源性比对分析发现,3个蛋白在DNA结合调控保守结构域序列较为保守,而在信号接收结构域变异较大,推测可能与接受不同信号分子有关.系统发育分析表明,CitB1和CitB3蛋白发挥的信号接收方式、下游基因调控功能在SRB群体中可能具有普遍性,CitB2蛋白的信号接收方式及基因调控可能具有特异性.结果表明,SRB中可能存在新型群体感应信号接收及调控机制.
文献关键词：
硫酸盐还原细菌;群体感应;调控基因;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
陈伟;刘晓艳;朱镭
作者机构：
湖北省农业科学院湖北省生物农药工程研究中心/国家生物农药工程技术研究中心/湖北省农业科技创新中心生物农药分中心,武汉 430064
文献出处：
引用格式：
[1]陈伟;刘晓艳;朱镭-.硫酸盐还原细菌类LuxR家族调控蛋白生物信息学分析)[J].湖北农业科学,2022(24):177-184
A类：
硫酸盐还原细菌,Hildenborough,citB1,citB2,citB3,CitB1,CitB3,CitB2
B类：
菌类,LuxR,调控蛋白,生物信息学分析,SRB,研究模式,Desulfovibrio,vulgaris,生物被膜,群体感应系统,调控因子,蛋白质序列,基因编码,彼此之间,信号接收,保守结构域,二级结构,无规则,卷曲,同源性,比对分析,信号分子,系统发育分析,白发,收方,基因调控,调控功能,群体感应信号,调控机制,调控基因
AB值：
0.240729
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