典型文献
安卡拉病毒贵州分离株Fiber2基因的克隆及序列分析
文献摘要：
Fiber2蛋白是禽腺病毒血清4型(FAdV-4,又称安卡拉病毒)重要的免疫原蛋白,为深入了解FAdV-4贵州株Fiber2基因的遗传变异情况,本研究利用PCR技术扩增FAdV-4贵州晴隆株(GZ-QL)Fiber2基因,胶回收后将其连接至pMD19-T载体,转化入DH5α筛选阳性克隆质粒,经质粒PCR及双酶切鉴定后进行DNA测序,然后对测序结果进行生物信息学分析.结果显示,GZ-QL株Fiber2基因全长为1440 bp,与四川分离的SCnj1601强毒株、北京分离的NIVD2强毒株Fiber2基因核苷酸同源性均为100.0％,与FAdV-4经典ON1株Fiber2基因核苷酸同源性为95.9％,两者位于相同进化分支.GZ-QL Fiber2蛋白共有33个氨基酸突变位点,其中,在第11～15位之间有5个氨基酸插入;蛋白质亲水性平均值为-0.031,其二级结构以无规则卷曲为主(占51.8％),无跨膜结构域或信号肽,抗原表位分布均匀,预测有8个优势抗原表位区域,且集中于N端.以上结果表明,FAdV-4贵州株GZ-QL Fi-ber2蛋白在禽腺病毒血清4型内相对保守且抗原性良好,具备成为优势抗原的潜力.
文献关键词：
禽腺病毒血清4型;Fiber2基因;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
方天;何玲;尹德晶;岳筠;朱二鹏;文明;程振涛
作者机构：
贵州大学动物科学学院,贵州 贵阳 550025;贵州省动物疫病预防控制中心,贵州 贵阳 550008;贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室,贵州 贵阳 550025
文献出处：
引用格式：
[1]方天;何玲;尹德晶;岳筠;朱二鹏;文明;程振涛-.安卡拉病毒贵州分离株Fiber2基因的克隆及序列分析)[J].江苏农业学报,2022(06):1603-1611
A类：
免疫原蛋白,SCnj1601,NIVD2,ber2
B类：
安卡拉病,分离株,Fiber2,序列分析,禽腺病毒,毒血,FAdV,遗传变异,变异情况,研究利用,晴隆,GZ,QL,pMD19,化入,DH5,质粒,双酶,生物信息学分析,全长,bp,毒株,同源性,ON1,进化分支,氨基酸突变,突变位点,亲水性,二级结构,无规则,卷曲,跨膜结构域,信号肽,抗原表位,抗原性
AB值：
0.277635
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