典型文献
莱鲍迪甙C高效转化细菌Paenarthrobacter ilicis CR5301全基因组测序及关键糖苷酶分析
文献摘要：
为全面了解Paenarthrobacter ilicis CR5301的遗传背景,深入解析CR5301转化莱鲍迪甙C(rebaudioside C,RC)的关键酶,采用二代Illumina HiSeq和三代Nanopore相结合的测序方法,对CR5301进行全基因组测序和关键酶预测分析.结果显示,CR5301基因组为1个闭合环状染色体DNA分子,不含质粒,基因组序列全长4 748 281 bp,GC含量62.92％,共编码4458个基因,同时含有4个基因岛、1个前噬菌体和14个CRISPR-Cas编码序列.CR5301是P.ilicis物种第1个测定基因组完成图的菌株,也是Paenarthrobacter菌属己知基因组最大的菌株.基因组共线性分析和16S rRNA基因系统进化树分析结果一致表明,P.ilicis CR5301与P.aurescens具有更近的亲缘关系,而与P.ureafaciens的亲缘关系较远.7个蛋白质数据库综合注释分析发现,P.ilicis CR5301基因组共含有523个碳水化合物活性酶基因,其中18个糖苷酶基因可能是CR5301转化RC的关键酶基因.最后,通过ProtParam、SOPMA生物信息学软件,预测了 18个糖苷酶的物化性质和二级结构.这些结果为CR5301的RC转化机制研究提供了清晰、完整的遗传信息,并且为P.ilicis物 种广泛的生物学研究提供了完整、可靠的参考基因组序列,对今后P.ilicis物种生物学研究具有重要的参考价值和普遍的借鉴意义.
文献关键词：
微生物转化;莱鲍迪甙C;Paenarthrobacter ilicis CR5301;基因组;糖苷酶
中图分类号：
作者姓名：
李洪飞;孙大庆;曹龙奎
作者机构：
黑龙江八一农垦大学国家杂粮工程技术中心,黑龙江大庆 163319;东北石油大学化学化工学院,黑龙江大庆 163318
文献出处：
引用格式：
[1]李洪飞;孙大庆;曹龙奎-.莱鲍迪甙C高效转化细菌Paenarthrobacter ilicis CR5301全基因组测序及关键糖苷酶分析)[J].食品科学,2022(18):166-175
A类：
ilicis,CR5301,rebaudioside,aurescens,ureafaciens
B类：
Paenarthrobacter,全基因组测序,糖苷酶,遗传背景,RC,Illumina,HiSeq,Nanopore,预测分析,闭合环,质粒,基因组序列,全长,bp,前噬菌体,CRISPR,Cas,编码序列,基因组完成图,基因组共线性,共线性分析,16S,rRNA,系统进化树分析,亲缘关系,较远,蛋白质数据库,碳水化合物活性酶,关键酶基因,ProtParam,SOPMA,生物信息学软件,物化性质,二级结构,转化机制,遗传信息,生物学研究,参考基因,微生物转化
AB值：
0.257554
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