典型文献
葡萄汁酵母NOT5基因生物信息学分析
文献摘要：
目的:从转录组分析数据中得到葡萄汁酵母NOT5基因,并对其进行生物学信息分析,为后期研究该基因的作用打下基础.方法:使用在线分析工具COILS Server、SOPMA、Alpha Fold等分析预测NOT5基因编码蛋白质的一级结构、二级结构、三级结构及其结构域.结果:葡萄汁酵母NOT5基因核苷酸序列的开放阅读框为1446 bp,可编码481个氨基酸,位于XVI染色体690107～691789,在系统发育树中与真贝酵母(Saccharomyces eubayanus NOT5 like protein XP018219088.1)NOT5基因的亲缘关系最近;其编码的蛋白质是不稳定的亲水蛋白,分子式为C2493H3848N654O795S19,分子质量为56311.02,不含信号肽,无跨膜区域,存在卷曲螺旋区域,亚细胞定位于细胞质中的线粒体上;蛋白质的二级结构以随机卷曲为主;预测存在Pfam Not3和Pfam NOT2_3_5结构域;以Yeast Not1-Not2-Not5(4by6.1.C)为模板构建NOT5蛋白的三级结构,两者的序列一致性可以达到89.88％.结论:葡萄汁酵母NOT5基因编码的蛋白结构不稳定,可能在细胞中互连翻译和转录.
文献关键词：
葡萄汁酵母;NOT5基因;生物信息学分析;转录组;在线分析工具
中图分类号：
作者姓名：
丁淑金;杨彦萍;邓茹友;马福仙;尹拓;张汉尧
作者机构：
西南林业大学林学院,西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室,云南昆明 650224
文献出处：
引用格式：
[1]丁淑金;杨彦萍;邓茹友;马福仙;尹拓;张汉尧-.葡萄汁酵母NOT5基因生物信息学分析)[J].食品工业科技,2022(18):145-151
A类：
葡萄汁酵母,NOT5,COILS,eubayanus,XP018219088,C2493H3848N654O795S19,Not3,NOT2,Not1,Not2,Not5,4by6
B类：
生物信息学分析,转录组分析,生物学信息分析,打下基础,在线分析工具,Server,SOPMA,Alpha,Fold,分析预测,基因编码,编码蛋白,二级结构,三级结构,结构域,开放阅读框,bp,可编,XVI,系统发育树,Saccharomyces,like,protein,亲缘关系,亲水,分子式,分子质量,信号肽,卷曲螺旋,亚细胞定位,细胞质,Pfam,Yeast,序列一致性,蛋白结构,互连
AB值：
0.25037
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