典型文献
分离自人体肠道的副干酪乳杆菌K56和ET-22的菌株鉴定
文献摘要：
以婴儿和成人肠道来源的菌株K56和ET-22为研究对象,选取8株其他来源菌株作为参考,采用形态学、生理生化、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱、全基因组测序、多位点序列分型分析和单核苷酸多态性(single nucleotide polymophism,SNP)分析,建立了适用于菌株K56和ET-22的鉴定方法.结果表明,菌株K56和ET-22及参考菌株的基质辅助激光解吸/电离飞行时间鉴定比对值大于2,平均核苷酸一致性值(average nucleo-tide identity,ANI)达到95％以上,在种水平均鉴定为副干酪乳杆菌(Lactobacillus paracasei);对副干酪乳杆菌K56、ET-22和参考菌株的1701个共有核心基因开展基于全基因组测序的多基因序列位点分析,菌株K56和ET-22可与其他参考菌株有效区分,SNP分析表明不同培养代数间副干酪乳杆菌K56的SNP差异为103、ET-22的SNP差异为49,系统发育分析表明该方法可以有效区分副干酪乳杆菌K56、ET-22与其他参考菌株.益生菌的安全性和功能性均在菌株水平具有特异性,已成为业内新的科学共识.该研究建立的益生菌K56和ET-22菌株水平精准鉴定方法体系,对促进其在乳品行业的广泛应用具有重要意义.
文献关键词：
副干酪乳杆菌;菌株鉴定;全基因组测序;多位点序列分型;单核苷酸多态性
中图分类号：
作者姓名：
刘艺茹;马霞;赵婷;刘锦浲;于学健;刘伟贤;程坤;张欣;曹艳花;辛迪;冯慧军;刘福东;赵雯;洪维鍊;姚粟
作者机构：
中国食品发酵工业研究院有限公司 中国工业微生物菌种保藏管理中心,北京,100015;内蒙古乳业技术研究院有限责任公司,内蒙古 呼和浩特,010110;内蒙古伊利实业集团股份有限公司,内蒙古 呼和浩特,010110
文献出处：
引用格式：
[1]刘艺茹;马霞;赵婷;刘锦浲;于学健;刘伟贤;程坤;张欣;曹艳花;辛迪;冯慧军;刘福东;赵雯;洪维鍊;姚粟-.分离自人体肠道的副干酪乳杆菌K56和ET-22的菌株鉴定)[J].食品与发酵工业,2022(01):62-69
A类：
K56,polymophism
B类：
副干酪乳杆菌,ET,菌株鉴定,婴儿,生理生化,基质辅助激光解析电离飞行时间质谱,全基因组测序,多位点序列分型,单核苷酸多态性,single,nucleotide,SNP,鉴定方法,参考菌株,激光解吸,定比,平均核苷酸一致性,average,identity,ANI,Lactobacillus,paracasei,核心基因,多基因,基因序列,列位,数间,系统发育分析,益生菌,株水平,科学共识,精准鉴定,方法体系,乳品行业
AB值：
0.208961
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