典型文献
基于数据库挖掘CLEC16A基因在KIPAN中的表达及其临床意义
文献摘要：
目的 基于数据挖掘,研究CLEC16A基因与混合性肾癌(KIPAN)发展、预后的关系及意义.方法 从TCGA数据库中下载KIPAN的CLEC16A基因表达谱及其临床信息,利用Perl脚本和R包进行处理并分析之间的关系.结果 CLEC16A在KIPAN中的表达较正常组织低,且随着KIPAN临床分级的提高,CLEC16 A的表达呈下调趋势.CLEC16 A低表达与KIPAN预后不良呈正相关(总生存率:HR=0.69,P=0.006;无病生存率:HR=0.72,P=0.028).基因富集分析结果显示,CLEC16A高表达主要在溶酶体和氧化磷酸化等生物学过程或通路存在富集.而CLEC16A低表达在抗原加工及呈递、免疫球蛋白A(IgA)肠道免疫网络产生、白细胞跨内皮迁移、NOD样受体信号通路、自然杀伤细胞介导的细胞毒性等信号通路中存在富集.结论 CLEC16A可能作为KIPAN发生的抑制物,其低表达是肾癌进展及不良预后的危险因素,高表达可能是抑制KIPAN发生的保护因子.
文献关键词：
CLEC16A;TCGA;数据挖掘;预后;混合性肾癌
中图分类号：
作者姓名：
郭亚楠;陈佳雯;蒋奕斌;温珍珍;林泱泱;朱潘婵;钱晶
作者机构：
湖州师范学院医学院,浙江湖州 313000;湖州学院,浙江湖州 313000;浙江省媒介生物学与病原控制重点实验室,浙江湖州 313000
文献出处：
引用格式：
[1]郭亚楠;陈佳雯;蒋奕斌;温珍珍;林泱泱;朱潘婵;钱晶-.基于数据库挖掘CLEC16A基因在KIPAN中的表达及其临床意义)[J].现代医药卫生,2022(18):3061-3067
A类：
CLEC16A,KIPAN,混合性肾癌,CLEC16
B类：
TCGA,下载,基因表达谱,临床信息,Perl,脚本,较正,正常组织,临床分级,低表达,预后不良,总生存率,无病生存率,基因富集分析,溶酶体,氧化磷酸化,生物学过程,抗原加工,呈递,免疫球蛋白,IgA,肠道免疫,跨内皮迁移,NOD,样受体,自然杀伤细胞,细胞毒性,抑制物,不良预后,保护因子
AB值：
0.238923
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