典型文献
基于生物信息学分析E74样转录因子3在卵巢浆液性囊腺癌中的表达及作用机制
文献摘要:
目的 采用生物信息学方法探讨E74样转录因子3(ELF3)mRNA在卵巢浆液性囊腺癌中的表达水平,及其对卵巢浆液性囊腺癌的诊断、预后评估价值,并分析其可能的作用机制.方法 从癌症基因组图谱数据库(TCGA)中获取2006至2021年内收录的379例卵巢浆液性囊腺癌组织样本和88例正常卵巢组织样本的临床信息以及ELF3 mRNA表达数据分析其表达差异,获取基因表达综合数据库(GEO)GSE38666数据集中12例正常卵巢上皮细胞及18例卵巢浆液性囊腺癌上皮细胞的测序结果进行ELF3 mRNA表达水平验证.比较卵巢浆液性囊腺癌组织与正常卵巢组织、卵巢浆液性囊腺癌上皮细胞与正常卵巢上皮细胞ELF3表达情况;比较不同临床病理特征患者卵巢浆液性囊腺癌组织ELF3 mRNA表达水平;分析ELF3 mRNA表达水平对卵巢浆液性囊腺癌的诊断价值;比较ELF3 mRNA高表达与低表达患者预后;富集分析ELF3在卵巢浆液性囊腺癌中可能参与的信号通路.结果 卵巢浆液性囊腺癌组织ELF3 mRNA表达水平高于正常卵巢组织(P<0.05).卵巢浆液性囊腺癌上皮细胞ELF3 mRNA表达水平高于正常卵巢上皮细胞(P<0.05).不同国际妇产科协会(FIGO)等级、初始治疗效果、种族、组织学分级、肿瘤发生部位、血管侵犯、肿瘤残留的患者卵巢浆液性囊腺癌组织ELF3 mRNA表达水平比较差异均无统计学意义(均P>0.05),年龄>60岁的患者卵巢浆液性囊腺癌组织ELF3 mRNA表达水平低于年龄≤60岁的患者(P<0.05).ELF3 mRNA表达水平诊断卵巢浆液性囊腺癌的ROC曲线显示AUC为0.988,最佳截断值为4.450,灵敏度为0.988,特异度为0.977.ELF3 mRNA低表达患者总生存期和疾病特异性生存期均优于高表达患者(均P<0.05).ELF3 mRNA表达相关的基因可能参与G蛋白偶联受体(GPCR)配体结合和神经元系统两条信号通路.结论 ELF3 mRNA表达水平在卵巢浆液性囊腺癌中具有较高的诊断、预后评估价值,高表达患者预后较差,并可能通过GPCR配体结合和神经元系统两条信号通路发挥作用.
文献关键词:
卵巢癌;E74样转录因子3;mRNA;诊断;预后
中图分类号:
作者姓名:
崔涵;张春雷;刘文珍
作者机构:
730050 兰州,中国人民解放军联勤保障部队第九四〇医院第一派驻门诊部;730050 兰州,中国人民解放军联勤保障部队第九四〇医院泌尿外科;730050 兰州,中国人民解放军联勤保障部队第九四〇医院第二派驻门诊部
文献出处:
引用格式:
[1]崔涵;张春雷;刘文珍-.基于生物信息学分析E74样转录因子3在卵巢浆液性囊腺癌中的表达及作用机制)[J].浙江医学,2022(13):1413-1417,后插5
A类:
E74,GSE38666
B类:
生物信息学分析,卵巢浆液性囊腺癌,生物信息学方法,ELF3,预后评估价值,癌症基因组图谱数据库,TCGA,内收,癌组织,卵巢组织,临床信息,表达差异,基因表达综合数据库,GEO,卵巢上皮细胞,临床病理特征,诊断价值,低表达,富集分析,同国,妇产科,科协,FIGO,初始治疗,种族,组织学分级,肿瘤发生,发生部位,血管侵犯,肿瘤残留,截断值,总生存期,疾病特异性生存期,偶联,GPCR,卵巢癌
AB值:
0.137788
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