目的 利用生物信息学的方法评估AP1M2基因在肝癌中的表达及临床意义.方法 采用UALCAN数据库分析AP1M2基因在肝癌患者中的表达水平及不同临床特征间的差异;GEPIA和Kaplan-Meier plotter数据库分析AP1M2基因对肝癌患者生存预后的影响;LinkedOmics数据库分析AP1M2在肝癌中的相关基因,同时利用R语言进行基因本体论功能注释和京都基因与基因组百科全书通路富集分析;通过STRING数据库构建AP1M2蛋白相互作用网络;TIMER数据库分析AP1M2基因表达与肿瘤免疫浸润的关系.结果 肝癌组织AP1M2表达水平显著高于癌旁正常组织(P<0.05);TP53突变肝癌患者AP1M2表达水平升高(P<0.05);AP1M2高表达组患者总生存率显著低于低表达组(P<0.05);AP1M2相关基因高度富集在核糖体、蛋白酶体、剪切体、凋亡、氨基酸代谢等信号通路,其与AP1B1、CLTC、AP3B1等10种蛋白存在相互作用;AP1M2表达水平与B细胞、CD8+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞的浸润程度均呈显著正相关(均P<0.05);Cox回归分析结果显示AP1M2和树突状细胞浸润均是肝癌患者预后不良的独立危险因素(均P<0.05).结论 AP1M2在肝癌中表达上调且与预后不良密切相关,可为肝癌的早期筛查、诊断及预后评估提供新思路.

肝癌;AP1M2基因;生物信息学

中国科学院大学宁波华美医院肝病科,浙江宁波 315010;天台县疾病预防控制中心检验科, 浙江天台 317200;浙江省消化系统肿瘤诊治及研究重点实验室,浙江宁波 315010

[1]徐晓珍;庞梦婷;慎强;高国生-.AP1M2在肝癌中的表达及临床价值研究)[J].中国现代医生,2022(19):24-29

AP1M2,AP1B1,AP3B1

临床价值,价值研究,利用生物,方法评估,UALCAN,数据库分析,肝癌患者,GEPIA,Kaplan,Meier,plotter,生存预后,LinkedOmics,基因本体论,论功,功能注释,京都基因与基因组百科全书通路富集,通路富集分析,STRING,数据库构建,蛋白相互作用网络,TIMER,肿瘤免疫浸润,肝癌组织,癌旁,正常组织,TP53,总生存率,低表达,核糖体,蛋白酶体,剪切体,氨基酸代谢,CLTC,种蛋,CD8+T,巨噬细胞,树突状细胞,浸润程度,Cox,细胞浸润,预后不良,早期筛查,预后评估

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