目的 采用生物信息学方法分析细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2A(CDKN2A)基因与宫颈癌的关系,并探讨其对宫颈癌潜在的调控机制.方法 从GEO数据库中下载数据集GSE7803、GSE64217和GSE63514,并使用GEO2 R软件筛选宫颈癌组织和正常组织之间的差异性表达基因,得到CDKN2 A基因在宫颈鳞状细胞癌组织中的表达情况,并利用GEPIA数据库验证CDKN2 A基因在宫颈鳞状细胞癌组织中的表达水平.通过DAVID在线工具针对差异性表达基因进行通路富集分析;利用STRING数据库和Cytoscape软件筛选与CDKN2 A基因编码蛋白相互作用密切的蛋白.利用UALCAN在线工具分析CDKN2 A基因表达与宫颈癌患者临床病理特征及预后的关系,以及宫颈癌组织中CDKN2 A基因启动子甲基化水平.利用TIMER数据库分析CDKN2 A基因表达水平与肿瘤免疫细胞浸润的相关性.利用ENCORI和mirDIP软件分析与CDKN2 A基因有结合靶点的miRNA.结果 共获得347个差异性表达基因,其中CDKN2 A基因为上调基因;GEPIA数据库验证结果提示CDKN2 A基因在宫颈鳞状细胞癌组织组织中呈高表达水平(P<0.05).CDKN2 A基因参与了细胞周期、p53信号通路及膀胱癌信号通路;共有22个蛋白与CDKN2A基因编码蛋白相互作用密切.淋巴结转移阳性宫颈癌患者中的CDKN2A基因表达水平高于淋巴结转移阴性者,CDKN2A基因高表达的宫颈癌患者的生存期短于低表达者(均P<0.05).宫颈癌组织中CDKN2A基因启动子的甲基化水平较正常宫颈组织升高(P<0.05).CDKN2A基因表达水平与巨噬细胞浸润水平呈负相关,与中性粒细胞、树突状细胞浸润水平呈正相关(均P<0.05).共有9个miRNA可能与CDKN2 A基因有结合靶点.结论 CDKN2 A基因与宫颈癌发生、发展密切相关,或可作为宫颈癌诊断及预后评估的潜在新分子标志物,并可为研究宫颈癌的免疫治疗提供新线索;该基因可能通过启动子区域甲基化或上游miRNA靶向调控在宫颈癌的发生、发展中发挥作用.

宫颈癌;细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2A;临床病理特征;预后;启动子区域甲基化;微小RNA;生物信息学

广西壮族自治区人民医院妇科,广西南宁市 530000;广西医科大学临床医学院,广西南宁市 530021

[1]刘珍;罗永金;胡晓霞-.基于生物信息学研究细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2A基因与宫颈癌的关系及调控机制)[J].广西医学,2022(12):1378-1383

GSE7803,GSE64217

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