典型文献
基于生物信息学分析FOXO4在肾透明细胞癌中的表达及临床意义
文献摘要：
目的 利用生物信息学方法分析叉头框蛋白O4(FOXO4)在肾透明细胞癌(简称肾癌)中的表达及临床意义.方法 Oncomine数据库可视化分析肾癌中FOXO4的表达,UALCAN数据库分析肾癌中FOXO4 mRNA和蛋白表达水平.采用CRISPR/dCas9方法使肾癌细胞系FOXO4过表达,RT-qPCR法检测肾癌细胞中FOXO4 mRNA表达水平.溴化噻唑蓝四氮唑法检测细胞存活能力.Kaplan-Meier plotter在线数据库分析FOXO4表达与肾癌预后的关系.使用4个在线数据库预测调控FOXO4表达的上游miRNA,通过StarBase数据库分析miRNA在肾癌样本中的表达及其与FOXO4表达的相关性,根据miRNA表达的中位值将肾癌样本分为高表达组和低表达组,分析预后关系.利用双荧光素酶报告基因实验验证它们的靶向调节关系.结果 从Oncomine和UALCAN数据库分析得到肾癌样本中FOXO4 mRNA和蛋白表达较正常肾组织样本均降低.769-P和786-O肾癌细胞中过表达FOXO4后其细胞存活水平均明显降低.Kaplan-Meier plotter在线数据库分析显示FOXO4低表达组总生存率低于高表达组.hsa-miR-142-3p是FOXO4表达的上游miRNA调控因子,其在肾癌样本中表达上调且与FOXO4表达呈负相关,hsa-miR-142-3p高表达不利于肾癌的预后.双荧光素酶报告基因结果显示hsa-miR-142-3p与FOXO4存在靶向调节关系.结论 FOXO4在肾癌中低表达,并与患者不良预后有关,有望成为改善肾癌预后的生物标志物和治疗的靶标.
文献关键词：
肾透明细胞癌;叉头框蛋白O4;miRNA;生物信息学;预后
中图分类号：
作者姓名：
吴承帅;陈兵海
作者机构：
212001 镇江,江苏大学附属医院泌尿外科
文献出处：
引用格式：
[1]吴承帅;陈兵海-.基于生物信息学分析FOXO4在肾透明细胞癌中的表达及临床意义)[J].浙江医学,2022(21):2298-2304,后插2
A类：
B类：
生物信息学分析,FOXO4,肾透明细胞癌,利用生物,生物信息学方法,叉头框蛋白,Oncomine,UALCAN,数据库分析,蛋白表达水平,CRISPR,dCas9,肾癌细胞,细胞系,过表达,qPCR,溴化,噻唑蓝,四氮唑,细胞存活,Kaplan,Meier,plotter,测调,miRNA,StarBase,中位值,低表达,预后关系,双荧光素酶报告基因实验,靶向调节,较正,肾组织,总生存率,hsa,3p,调控因子,不良预后,生物标志物,靶标
AB值：
0.212582
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