典型文献
基于生物信息学分析α-肌动蛋白1在胃癌中的表达情况及临床意义
文献摘要：
目的 分析ACTN1基因在胃癌组织和癌旁正常组织中的表达差异,探讨其与胃癌免疫浸润水平、预后的相关性及其可能的信号通路及互作蛋白.方法 通过TCGA、GEO数据库分析ACTN1在胃癌组织及癌旁正常组织中的表达差异;通过Kaplan-Meier数据库分析ACTN1与胃癌患者预后的相关性;通过Timer与TISIDB数据库分析ACTN1与胃癌免疫浸润水平的相关性;通过cBio-Portal数据库获取ACTN1在胃癌中的共表达基因,并对ACTN1及共表达基因进行GO及KEGG富集分析;通过String数据库及Cytoscape软件构建蛋白互作网络并筛选Hub基因,分析ACTN1与Hub基因的相关性.结果 ACTN1基因在胃癌组织中呈现高表达;ACTN1高表达的胃癌患者总体生存率与低表达患者相比显著降低;胃癌组织中ACTN1表达量与巨噬细胞、中央记忆CD4+T细胞、效应CD4+T细胞、浆细胞样树突状细胞呈正相关,与活化CD4+T细胞呈负相关;GO及KEGG分析显示ACTN1及共表达基因可能通过参与细胞外基质组织、细胞外结构组织、细胞连接组装等生物学过程,并与FN1、FERMT2、ITGB5、FLNA、ITGAV、ITGB1、ILK、ITGA5、PARVA等基因表达密切相关.结论 ACTN1基因与胃癌患者的不良预后及肿瘤免疫浸润水平密切相关,可作为一个潜在的用于诊断及预后评估的分子生物学标志物.
文献关键词：
胃癌;α-肌动蛋白1;ACTN1;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
张浩;杨子;左芦根
作者机构：
233000 安徽蚌埠,蚌埠医学院第一附属医院胃肠外科
文献出处：
引用格式：
[1]张浩;杨子;左芦根-.基于生物信息学分析α-肌动蛋白1在胃癌中的表达情况及临床意义)[J].齐齐哈尔医学院学报,2022(05):406-411
A类：
cBio,FERMT2,PARVA
B类：
生物信息学分析,肌动蛋白,ACTN1,胃癌组织,癌旁,正常组织,表达差异,免疫浸润水平,互作蛋白,TCGA,GEO,数据库分析,Kaplan,Meier,胃癌患者,Timer,TISIDB,Portal,共表达基因,富集分析,String,Cytoscape,软件构建,蛋白互作网络,Hub,总体生存率,低表达,巨噬细胞,CD4+T,浆细胞样树突状细胞,细胞外基质,细胞连接,连接组,生物学过程,FN1,ITGB5,FLNA,ITGAV,ITGB1,ILK,ITGA5,不良预后,肿瘤免疫浸润,预后评估,分子生物学标志物
AB值：
0.307256
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