典型文献
基于自噬相关基因构建的预后模型对脑胶质瘤免疫微环境的影响
文献摘要：
目的 利用TCGA公共数据库筛选脑胶质瘤中与缺氧诱导因子(HIF-1α)表达相关的自噬相关基因(ARGs),分析其对患者生存预后的影响并构建风险评估模型及与肿瘤免疫微环境的关系.方法 从TCGA中提取脑胶质瘤患者的临床信息和基因表达数据,通过Pearson相关性分析筛选与HIF-1α表达有关的ARGs.GO和KEGG富集分析信号通路和生物学行为.单因素和多因素Cox回归分析选出对胶质瘤患者的生存预后有影响的ARGs.以中位数为截断值构建风险评估模型,ROC曲线及K-M生存曲线评估模型性能,并分析风险评估模型与免疫微环境的关系.结果 共筛选出2370个基因与HIF-1α存在相关性,其中有40个与HIF-1α表达相关的ARGs;GO和KEGG富集分析显示,其与细胞死亡的调控相关;单因素Cox回归分析显示,与生存预后相关的基因有36个;利用多因素Cox回归确定了 4个ARGs(CASP3、MAPK9、NAMPT、CAMKK2)并构建了风险评估模型,其中3年时AUC最大,为0.89;K-M生存曲线显示,低风险组生存率高于高风险组;ESITMATE算法显示,高风险组免疫浸润评分高于低风险组;免疫检查点基因结果显示,高风险组PD1、PDL1、PDL2、LAG3、B7H3、TIM3、CTLA4高于低风险组;免疫细胞浸润结果显示,高风险组单核细胞、活化自然杀伤细胞和浆细胞低于低风险组.结论 本研究构建了 HIF-1α相关的ARGs预后模型,揭示了缺氧环境调控自噬相关基因对于胶质瘤患者临床预后及免疫治疗的影响.
文献关键词：
脑胶质瘤;缺氧诱导因子;自噬;免疫微环境
中图分类号：
作者姓名：
乔秋江;庞琦
作者机构：
山东大学附属山东省立医院神经外科,山东 济南250021
文献出处：
引用格式：
[1]乔秋江;庞琦-.基于自噬相关基因构建的预后模型对脑胶质瘤免疫微环境的影响)[J].医学信息,2022(17):1-6
A类：
CAMKK2,ESITMATE,PDL2
B类：
自噬相关基因,预后模型,脑胶质瘤,TCGA,公共数据库,缺氧诱导因子,HIF,ARGs,生存预后,风险评估模型,肿瘤免疫微环境,临床信息,基因表达数据,富集分析,生物学行为,Cox,中位数,截断值,生存曲线,模型性能,细胞死亡,CASP3,MAPK9,NAMPT,低风险组,高风险组,法显,免疫浸润,免疫检查点基因,PD1,PDL1,LAG3,B7H3,TIM3,CTLA4,免疫细胞浸润,单核细胞,自然杀伤细胞,浆细胞,研究构建,缺氧环境,环境调控,临床预后,免疫治疗
AB值：
0.291397
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