目的 采用数据挖掘技术探讨亚甲基四氢叶酸脱氢酶2基因(MTHFD2)在膀胱癌中的表达、生物学功能、相关信号通路及其与患者预后的关系.方法 在癌症基因组图谱数据库(TCGA)中比较人多种实体肿瘤及膀胱癌组织和正常组织中MTHFD2基因mRNA的相对表达水平,String数据库构建MTHFD2基因相关蛋白-蛋白相互作用网络,对MTHFD2及相关基因功能进行KEGG信号通路功能富集;根据膀胱癌患者癌组织中MTHFD2基因表达中位数分为高、低表达组,绘制风险比例模型,Log-rank检验比较MTHFD2高低表达组患者总生存期(OS)和无病生存期(DFS)有无差异.结果 MTHFD2基因mRNA在人体大多数肿瘤组织中呈现高表达(P<0.05);MTHFD2基因mRNA在癌组织中重度表达水平高于癌旁正常组织(P<0.05),随着MTHFD2基因mRNA表达水平的增高,膀胱癌的分期也增加(P<0.05);MTHFD2蛋白-蛋白相互作用网络中共有21个蛋白和47个相互作用,各蛋白平均相互作用指数为0.893,网络中各个蛋白富集明显(P<0.05);MTHFD2基因功能主要富集于上皮肿瘤发生、线粒体和甲酰基及相关转移酶活性;MTHFD2基因表达与CD8+T细胞(r=0.364)、巨噬细胞(r=0.145)、中性粒细胞(r=0.269)及树突状细胞(r=0.407)存在相关性;MTHFD2高表达组膀胱癌患者OS(HR=1.5,P=0.00062)和DFS(HR=1.5,P=0.015)低于低表达组.结论 MTHFD2在膀胱癌患者癌组织中呈高表达水平,其可能参与了膀胱癌的发生与发展,并与患者的预后不良有关.

膀胱癌;MTHFD2基因;无病生存期;淋巴细胞

任默涵;于东海;吴迪

天津市第三中心医院放射科,天津 300170

医学信息

[1]任默涵;于东海;吴迪-.MTHFD2基因在膀胱癌中的表达、功能富集及信号通路的生物信息学分析)[J].医学信息,2022(24):18-22

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