典型文献
肠炎沙门菌avrA蛋白的原核表达及其生物信息学分析
文献摘要:
[目的]表达具有生物学活性的肠炎沙门菌(Salmoniella Enteritidis)avrA蛋白,并对其进行生物信息学分析,为研究肠炎沙门菌avrA蛋白对猪肠道细胞免疫功能的影响提供参考.[方法]根据GenBank中肠炎沙门菌avrA蛋白全基因序列(基因ID:1254388)设计引物扩增avrA基因,回收的目的片段与表达载体pGEX-4T-1进行重组、克隆,用限制性内切酶和基因测序验证重组表达质粒的正确性.将验证后的重组表达质粒转化大肠杆菌Rosetta 2(DE3)感受态细胞,并在不同条件下对重组表达菌进行诱导表达.应用SDS-PAGE和Western blotting检测avrA蛋白的表达情况.将酶切测序后目的基因序列进行BLAST比对分析,并用ExPASy-Translate Tool软件预测avrA蛋白的氨基酸组成.应用生物信息学软件预测avrA蛋白的跨膜结构域、二级结构、三级结构及抗原性.[结果]肠炎沙门菌avrA基因CDS序列全长为909 bp,编码302个氨基酸.限制性内切酶及基因测序分析结果表明,重组表达质粒pGEX-4T-1-avrA构建成功.SDS-PAGE和Western-blotting结果表明,重组菌所表达的avrA蛋白为可溶性蛋白.重组菌在15℃诱导16 h表达的蛋白量为10 mg/L,蛋白溶解度为40%.生物信息学分析表明,avrA蛋白为膜外蛋白,该蛋白的16-301位氨基酸具有来自超家族YopJ丝氨酸/苏氨酸乙酰转移酶的保守结构域;avrA蛋白二级结构中无规则卷曲、α-螺旋、延伸链分别占43.71%、39.40%和16.89%;avrA蛋白三级结构预测结果与二级结构一致;avrA蛋白有9个与B细胞结合的抗原表位,分别在第5-40、51-68、80-92、94、101-109、146-157、160-168、199-231和236-298位氨基酸处.[结论]试验成功克隆出肠炎沙门菌avrA基因,并成功构建重组表达质粒和表达菌,诱导表达的avrA蛋白为可溶性表达;avrA蛋白为膜外蛋白,有9个能与B细胞结合的抗原表位.本研究结果为进一步制备检测肠炎沙门菌感染的抗体提供参考.
文献关键词:
肠炎沙门菌;avrA蛋白;原核表达;生物信息学分析
中图分类号:
作者姓名:
徐云明;卜永谦;卞蓉蓉;杨剑波;孙智远;陈益;柳增善;任洪林
作者机构:
江苏农林职业技术学院畜牧兽医学院,句容212400;句容市农业农村局,句容212400;吉林大学人兽共患病研究所教育部重点实验室,长春130062
文献出处:
引用格式:
[1]徐云明;卜永谦;卞蓉蓉;杨剑波;孙智远;陈益;柳增善;任洪林-.肠炎沙门菌avrA蛋白的原核表达及其生物信息学分析)[J].中国畜牧兽医,2022(11):4168-4177
A类:
Salmoniella,Translate,YopJ
B类:
肠炎沙门菌,avrA,原核表达,生物信息学分析,生物学活性,Enteritidis,猪肠,肠道细胞,细胞免疫功能,GenBank,中肠,全基因序列,ID,引物,表达载体,pGEX,4T,限制性内切酶,基因测序,重组表达,质粒,大肠杆菌,Rosetta,DE3,感受态,不同条件下,诱导表达,SDS,PAGE,blotting,目的基因,BLAST,比对分析,ExPASy,Tool,软件预测,氨基酸组成,生物信息学软件,跨膜结构域,三级结构,抗原性,CDS,全长,bp,测序分析,可溶性蛋白,蛋白量,溶解度,超家族,丝氨酸,苏氨酸,转移酶,保守结构域,蛋白二级结构,无规则,卷曲,结构预测,抗原表位,可溶性表达,沙门菌感染
AB值:
0.276184
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