典型文献
异麦芽酮糖减少小鼠肝脏脂肪堆积的关键基因筛选与验证
文献摘要:
为筛选和验证异麦芽酮糖减少小鼠肝脏脂肪堆积的关键基因,本研究利用Limma软件包对异麦芽酮糖和蔗糖饲喂22周的雄性小鼠肝脏转录组数据进行差异表达分析(GSE54723,n=14),共筛选出49个DEGs,通过Metascape软件对DEGs进行GO功能富集分析和KEGG信号通路分析,使用Cytoscape软件和WGCNA软件包构建基因共表达网络,取重叠基因搜寻关键节点基因,挖掘得到10个关键节点基因Pnliprp1、Prss2、Clps、Tff2、Pnlip、Ctrl、Cpa1、Cel、Dmbt1、Vil1,基因功能分析表明Pnlip、Pnliprp1、Cel、Clps与脂质代谢相关.qPCR结果显示,异麦芽酮糖组肝脏组织中这4个与脂质代谢相关基因的表达量显著高于蔗糖组,通过比较正常人和非酒精性脂肪肝患者肝脏组织转录组数据中上述基因的表达量(GSE163211,n=318),发现正常人Pnlip、Pnliprp1、Cel、Clps基因表达量亦显著(P<0.05)高于病例组.本研究揭示了异麦芽酮糖通过上调Pnlip、Pnliprp1、Cel、Clps的合成促进脂肪分解从而降低肝脏脂质的积累,为异麦芽酮糖影响肝脏脂质代谢的分子机制研究提供了理论支撑.
文献关键词:
异麦芽酮糖;蔗糖;转录组数据;节点基因;脂质代谢
中图分类号:
作者姓名:
何秋玲;张彩平;桂静;刘泳杏;季久秀;周波;张震
作者机构:
桂林医学院药学院,广西桂林 541199;桂林医学院智能医学与生物技术学院,广西桂林 541199;临沂大学农林科学学院,山东临沂 276005;桂林医学院科学实验中心,广西桂林 541199
文献出处:
引用格式:
[1]何秋玲;张彩平;桂静;刘泳杏;季久秀;周波;张震-.异麦芽酮糖减少小鼠肝脏脂肪堆积的关键基因筛选与验证)[J].食品工业科技,2022(16):1-8
A类:
GSE54723,Pnliprp1,Prss2,Clps,Tff2,Pnlip,Cpa1,Dmbt1,Vil1,GSE163211
B类:
异麦芽酮糖,小鼠肝脏,肝脏脂肪,脂肪堆积,关键基因筛选,研究利用,Limma,软件包,蔗糖,饲喂,雄性小鼠,肝脏转录组,转录组数据,差异表达分析,DEGs,Metascape,功能富集分析,通路分析,Cytoscape,WGCNA,基因共表达网络,重叠基因,搜寻,关键节点,节点基因,Ctrl,Cel,基因功能分析,qPCR,肝脏组织,脂质代谢相关基因,较正,正常人,非酒精性脂肪肝,基因表达量,脂肪分解,肝脏脂质代谢
AB值:
0.239306
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