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猪瘟脾淋苗免疫仔猪9d外周血细胞转录谱分析
文献摘要：
目的:分析猪瘟脾淋苗免疫仔猪9d的外周血细胞转录组数据,完善猪瘟脾淋苗免疫机理研究.方法:采集免疫猪瘟脾淋苗9 d小猪(5头)的外周血细胞进行转录组测序分析,并以脾淋组织免疫为对照(5头).结果:猪瘟脾淋苗组与脾淋组织对照组相比,差异表达的基因(Differentially Expressed Genes,DEGs)有17382个,显著差异的DEGs有605个(P<0.05),其中上调的有294个,下调的有311个;将DEGs进行基因本体论(Gene Ontology,GO)功能富集分析,发现免疫后9 d,富集的条目有1044个,与生物过程相关的有749个,其中酰胺生物合成过程、细胞酰胺代谢过程、翻译等23个过程显著富集(Q<0.05);与细胞组分相关的有145个,其中胞质核糖体、核糖体亚基、核糖体等15个组分显著富集(Q<0.05);与分子功能相关的有150个,核糖体结构成分、结构分子活性、RNA结合3个功能显著富集(Q<0.05);DEGs在京都基因与基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)中富集的信号通路数量有263个,差异显著的通路有10个(P<0.05),包含核糖体、生热作用、一磷酸腺苷活化蛋白激酶信号通路等.结论:本研究提供了猪瘟脾淋苗免疫仔猪9d的外周血细胞转录组谱,猪瘟脾淋苗可激活外周血细胞核糖体等信号通路,促进蛋白质生物合成.
文献关键词：
猪瘟脾淋苗;仔猪;外周血;RNA-seq
中图分类号：
作者姓名：
包松英
作者机构：
兆丰华生物科技(福州)有限公司 福州 350014
文献出处：
引用格式：
[1]包松英-.猪瘟脾淋苗免疫仔猪9d外周血细胞转录谱分析)[J].福建畜牧兽医,2022(05):31-36
A类：
猪瘟脾淋苗
B类：
仔猪,9d,外周血细胞,转录谱,转录组数据,免疫机理,小猪,转录组测序分析,差异表达,Differentially,Expressed,Genes,DEGs,基因本体论,Ontology,功能富集分析,条目,生物过程,生物合成,合成过程,代谢过程,核糖体,亚基,京都,基因组数据,Kyoto,Encyclopedia,Genomes,中富,路数,生热,热作用,一磷酸腺苷,磷酸腺苷活化蛋白激酶,可激活,细胞核,seq
AB值：
0.283179
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